Quelltext der Seite SYPRO Ruby

[[Datei:SYPRO Ruby.svg|mini|Struktur von SYPRO Ruby, soweit bekannt.<ref name="Demchenko" />]]

'''SYPRO Ruby''' ist ein [[Fluoreszenzfarbstoff]] vom [[Ruthenium]]-[[Chelatkomplex]]-Typ,<ref name="Demchenko">Aleksandr Petrovich Demchenko: ''Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology III: Applications in Sensing and Imaging Band 3 von Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology''. Springer 2011. ISBN 9783642180354. S. 181ff.</ref> der zur [[Proteinfärbung|Färbung]] von [[Protein]]en im Zuge einer [[Proteincharakterisierung]] verwendet wird, meistens in einem [[Western Blot]], in [[2D-Gelelektrophorese|2D-Gelen]] oder [[Isoelektrische Fokussierung|IEF-Gelen]].<ref name="Sigma" /><ref>K. Berggren, T. H. Steinberg, W. M. Lauber, J. A. Carroll, M. F. Lopez, E. Chernokalskaya, L. Zieske, Z. Diwu, R. P. Haugland, W. F. Patton: ''A luminescent ruthenium complex for ultrasensitive detection of proteins immobilized on membrane supports.'' In: ''Analytical biochemistry.'' Band 276, Nummer 2, Dezember 1999, S.&nbsp;129–143, {{ISSN|0003-2697}}. {{DOI|10.1006/abio.1999.4364}}. PMID 10603235.</ref><ref>S. Gallagher, D. Chakavarti: ''Staining proteins in gels.'' In: ''Journal of visualized experiments : JoVE.'' Nummer 17, 2008, S.&nbsp;, {{ISSN|1940-087X}}. {{DOI|10.3791/760}}. PMID 19066521. {{PMC|3253607}}.</ref>

== Eigenschaften ==
SYPRO Ruby bindet selektiv an basische Aminosäuren<ref name="Demchenko" /> von Proteinen (auch [[Glykoprotein]]e) in [[Natriumlaurylsulfat|SDS]]-[[Micelle]]n,<ref name="Demchenko" /> nicht jedoch an [[DNA]].<ref name="Sigma">{{Sigma-Aldrich|Sigma|S4942|Name=SYPRO Ruby Protein Gel Stain|Abruf=2013-11-28}}</ref><ref>T. Rabilloud, J. M. Strub, S. Luche, A. van Dorsselaer, J. Lunardi: ''A comparison between Sypro Ruby and ruthenium II tris (bathophenanthroline disulfonate) as fluorescent stains for protein detection in gels.'' In: ''Proteomics.'' Band 1, Nummer 5, Mai 2001, S.&nbsp;699–704, {{ISSN|1615-9853}}. {{DOI|10.1002/1615-9861(200104)1:5<699::AID-PROT699>3.0.CO;2-C}}. PMID 11678039.</ref> Die [[Mutagen]]ität, [[Reproduktionstoxizität]] und [[Karzinogen]]ität von SYPRO Ruby ist unbekannt.<ref name="Sigma" /> Die [[Absorption (Physik)|Absorptionsmaxima]] liegen bei λ = 280 nm und 450 nm, die Emission ist bei λ = 610 nm maximal.<ref name="Sigma" /> Die Sensitivität bei SDS-PA-Gelen liegt mit SYPRO Ruby bei etwa 1 ng Protein,<ref name="Sigma" /> also etwa vergleichbar mit der [[Silberfärbung]].<ref>A. Lamanda, A. Zahn, D. Röder, H. Langen: ''Improved Ruthenium II tris (bathophenantroline disulfonate) staining and destaining protocol for a better signal-to-background ratio and improved baseline resolution.'' In: ''Proteomics.'' Band 4, Nummer 3, März 2004, S.&nbsp;599–608, {{ISSN|1615-9853}}. {{DOI|10.1002/pmic.200300587}}. PMID 14997483.</ref> Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Ruby-Färbung bei einer Mengenabschätzung im Vergleich zur Silberfärbung oder [[Coomassie]] einen größeren linearen dynamischen Bereich, d. h. eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensität.<ref name="Sigma" /><ref>M. F. Lopez, K. Berggren, E. Chernokalskaya, A. Lazarev, M. Robinson, W. F. Patton: ''A comparison of silver stain and SYPRO Ruby Protein Gel Stain with respect to protein detection in two-dimensional gels and identification by peptide mass profiling.'' In: ''Electrophoresis.'' Band 21, Nummer 17, November 2000, S.&nbsp;3673–3683, {{ISSN|0173-0835}}. {{DOI|10.1002/1522-2683(200011)21:17<3673::AID-ELPS3673>3.0.CO;2-M}}. PMID 11271486. </ref> Die SYPRO Ruby-Färbung besitzt eine vergleichsweise längere Färbezeit von vier Stunden.

== Einzelnachweise ==
<references />

{{DEFAULTSORT:Sypro Ruby}}
[[Kategorie:Fluoreszenzfarbstoff]]
[[Kategorie:Bipyridin]]
[[Kategorie:Komplex]]
[[Kategorie:Rutheniumverbindung]]
[[Kategorie:Benzolsulfonat]]
[[Kategorie:Proteinfarbstoff]]
[[Kategorie:Biochemisches Nachweisverfahren]]