Diskussion:Supercoiled DNA

Komischer Satz

Was soll das heissen: "Geometrisch sitzt noch eine Dimension Spiralisation auf der Spirale auf, die auch praktisch nachzuweisen ist." ? was zur hölle sitzt wo auf?! möglicherweise ist das fachsprache und ich verstehs deswegen nicht! bitte um änderung und/oder verlinkung!!

danke! (nicht signierter Beitrag von 88.130.196.79 (Diskussion) 01:02, 25. Nov. 2014 (CET))

Funktion

Irreführende Aussage: "Supercoiled DNA kommt in jeder lebenden Zelle vor. Sie sorgt dafür, dass stets eine Mindestmenge von Basenpaaren geöffnet ist, um so den Polymerasen zu ermöglichen, den Vorlage-Strang zum neuen Doppelstrang zu ergänzen."

So weit ich weiß führt Superspiralisierung nicht dazu, dass die beiden Stränge der Doppelhelix teilweise getrennt sind, sprich H-Brücken zwischen den Basen aufgelöst. Der Zweck der Superspiralisierung besteht darin, die DNA des Genoms, die in ihrer Länge um ein Vielfaches größer als die Zelle (bei Prokaryoten) bzw. Zellkern (bei Eukaryoten) ist, überhaupt hineinpacken zu können. D.h. Komprimierung.(nicht signierter Beitrag von 90.134.56.43 (Diskussion) 22:46, 27. Aug. 2008 (CEST))

DNA-Supercoiling und DNA-Breathing

Zur obigen Diskussion: Das Supercoiling von DNA scheint Einfluß auf das sogenannte DNA-Breathing zu haben. Darunter versteht man die Fluktuation eines dsDNA-Moleküls, indem selbst bei biologischer Temperatur durch geringgradige Temperaturschwankungen, Wasserstoffbrückenbindungen zwischen den DNA-Basen aufbrechen [1]. Es resultiert ein sich Entfernen und Wiederannäheren von DNA-Basen mit Amplituden im Nanometerbereich [2]. Das DNA-Breathing steht damit im Zusammenhang mit kurzzeitig und lokalisiert bestehenden Einzelstrangstrukturen. Diese werden im Bereich von dsDNA-Enden als Fork (Gabel), inmitten eines Doppelstrangs als Bubbles (Blasen) bezeichnet. Es wird angenommen, dass abhängig von der Basen-Sequenz und der Länge eines dsDNA-Moleküls solche Einzelstrangstrukturen an bestimmten Loci der dsDNA auftreten [1]. So nimmt man an, dass Proteine bzw. Enzyme so erleichter Zugang zur Basensequenz erhalten [3]. Der Zusammenhang mit dem Supercoiling besteht darin, dass man beobachten konnte, dass ein Supercoiling einen erleichterten Zugang zu Doppelsträngiger DNA beispielsweise für Peptidnukleinsäuren (PNAs) ermöglicht und man in diesem Zusammenhang zu dem Schluß kommt, dass DNA-Breathing bei supercoided DNA stärker ausgeprägt ist [3]. Somit ist meiner Ansicht nach die hier diskutierte Aussage nicht unbedingt als falsch anzusehen.

Literatur

• [1] Peyrard M, Cuesta-López S, James G: Nonlinear analysis of the dynamics of DNA breathing. J Biol Phys 35: 73-89 (2009)
• [2] Lee OC, Jeon JH, Sung W: How double-stranded DNA breathing enhances its exibility and instability on short length scales. Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys 81: 021906 (2010)
• [3] Bentin T, Nielsen PE: Enhanced peptide nucleic acid binding to supercoiled DNA: possible implications for DNA breathing dynamics. Biochemistry 35: 8863-8869 (1996)

-- J.R.wiki 15:57, 9. Sep. 2010 (CEST)

Ich finde diese Ausführungen interessant, außerdem sind sie gut geschrieben. Was spricht dagegen, sie in dieser Form in den Artikel aufzunehmen? --77.191.242.178 22:57, 19. Okt. 2011 (CEST)

Linksgängige und rechtsgängige Verdrillung vertauscht?

Ich bin mir nicht 100% sicher, aber es sollte eigentlich so sein, dass negative Supercoils linksgängig(left-handed) und positive Supercoils rechtsgängig (right-handed) sind. (nicht signierter Beitrag von Orestaklos (Diskussion | Beiträge) 13:07, 1. Apr. 2020 (CEST))