Rudiviridae
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„Stygiolobus rod-shaped virus“ (SRV), | ||||||||||||||||
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Rudiviridae
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Die Virusfamilie Rudiviridae mit der einzigen Gattung Rudivirus umfasst unbehüllte Bakteriophagen mit einem Strang doppelsträngiger, linearer DNA als Genom. Die bisher klassifizierten zwei Virusspezies haben thermophile Archaeen der Abteilung Crenarchaeota zum Wirt; besonders gut beschrieben ist ihr Vorkommen in Sulfolobus islandicus ([en], Klasse Thermoprotei).
Die Bezeichnung der Familie leitet sich vom lateinischen rudis (Rapier, kleiner Stab) ab, was auf die längliche Form der Viren hindeuten soll.
Morphologie und Genom
Die Virionen der Rudiviridae sind stabförmig mit einem konstanten Durchmesser von 23 nm und einer variablen Länge von 830 bis 900 nm. Dieses helikale Kapsid ist aus spiralförmig angeordneten Molekülen eines DNA-bindenden Kapsidproteins aufgebaut. Die Windungen der Spirale wiederholen sich alle 4,3 nm. An den Enden der Virionen erkennt man stöpselartige Strukturen, die das Kapsid verschließen und an denen sich kurze Fibrillen befinden.
Das Genom der Rudiviren besteht aus einem einzigen Strang einer doppelsträngigen DNA mit einer Größe von 32 bis 35 kBp. Das Genom enthält offene Leserahmen für 45 (SIRV-1) bzw. 54 (SIRV-2) virale Proteine. Typisch sind sehr lange repetitive Sequenzen an den Enden des DNA-Stranges.
Systematik
Die Systematik der Ruduviridae nach ICTV mit weiteren Vorschlägen nach NCBI (Stand Mitte März 2021):
- Familie Rudiviridae
- Gattung Rudivirus
- Spezies Acidianus rod-shaped virus 1 (ARV1)
- Spezies Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-Virus 1 (en. Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 1, SIRV-1)
- Spezies Sulfolobus-islandicus-rod-shaped-Virus 2 (en. Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2, SIRV-2, Typusspezies)[2]
- Spezies „Acidianus rod-shaped virus 2“ (ARV2)
- Spezies „Acidianus rod-shaped virus 3“ (ARV3)
- Spezies „Metallosphaera rod-shaped virus 1“
- Spezies „Sulfolobus islandicus rudivirus 3“ (SIRV-3)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 4“ (SIRV-4)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 5“ (SIRV-5)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 6“ (SIRV-6)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 7“ (SIRV-7)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 8“ (SIRV-8)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 9“ (SIRV-9)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 10“ (SIRV-10)
- Spezies „Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 11“ (SIRV-11)
- Spezies „Stygiolobus rod-shaped virus“ (SRV)
Ursprünglich wurde die Virusspezies Thermoproteus-tenax-Virus 4 (TTV4) in die Gattung Rudivirus klassifiziert. Da sich die Morphologie jedoch erheblich unterscheidet und nicht ausreichend Sequenzinformationen vorliegen, wurde das TTV4 als unklassifizierte Virusspezies keiner bestehende Virusfamilie zugeordnet. Eine neue Virusfamilie Bacilloviridae wurde vorgeschlagen,[3] jedoch nicht vom ICTV akzeptiert.
Ähnlichkeiten zu anderen Viren
Das Genom zeigt Ähnlichkeiten mit der Virusfamilie Poxviridae bei Wirbeltieren.[4] Dies betrifft die Anordnung und Reihenfolge der Gene wie auch die Replikation des Genoms in der infizierten Zelle. Auffällige Sequenzübereinstimmungen von bis zu 30 % bestehen zur Familie Lipothrixviridae, deren Mitglieder bis auf eine zusätzliche Virushülle auch einen ähnlichen, helikalen Aufbau des Kapsids zeigen. Aufgrund erweiterter Sequenzanalysen kann ein gemeinsamer evolutionärer Ursprung der beiden Familien Rudiviridae und Lipothrixviridae angenommen werden, weshalb sie seit 2012 zu einer neuen, gemeinsamen Ordnung Ligamenvirales zusammengefasst sind.
Einzelnachweise
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
- ↑ Patrick Forterre: Evolution - Die wahre Natur der Viren, in: Spektrum August 2017, S. 37—41 (Online-Artikel vom 19. Juli 2017). Hier insbes. die Abb. S. 39.
- ↑ W. Zillig, D. Prangishvilli et al.: Viruses, plasmids and other genetic elements of thermophilic and hyperthermophilic Archaea. FEMS Microbiol, Rev. (1996) 18 (2-3): S. 225–236 (Review) PMID 8639330
- ↑ H. Blum, W. Zillig et al.: The genome of the archaeal virus SIRV1 has features in common with genomes of eukaryal viruses. Virology (2001) 281(1): S. 6–9 PMID 11222090
Literatur
- K. Stedman, D. Prangishvili: Family Rudiviridae. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego 2004, S. 103–106
