SARS-CoV-2-Variante Gamma
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Die SARS-CoV-2-Variante Gamma ist eine durch Mutation entstandene Variante des Betacoronavirus SARS-CoV-2. Sie wird in der Pango-Nomenklatur mit P.1 (alias B.1.1.28.1) bezeichnet (zuvor 20J/501Y.V3) und wurde erstmals im November 2020 im brasilianischen Manaus festgestellt, nachdem im Oktober 2020 dort sowie in der Region Amazonas die Infektionszahlen sprunghaft um 67 % angestiegen waren. Die WHO vergab ab 1. Juni 2021 griechische Buchstaben für die Bezeichnung der SARS-CoV-2-Varianten, um eine Stigmatisierung von Ländern zu vermeiden. Infektionen mit dieser Variante des SARS-CoV-2-Erregers wurden auch aus Japan gemeldet, wohin sie durch Reisende eingeschleppt wurde.[2]
- In Brasilien wurde der erste Verdachtsfall am 15. Dezember 2020 gemeldet.
- Der erste Labornachweis der Gamma-Variante datiert vom 6. Januar 2021, festgestellt in Japan.
- Im Januar 2021 meldeten Belgien, Deutschland, Färöer-Inseln, Guyana, Italien, Japan, Kolumbien, Niederlande, Südkorea, Taiwan, USA, Uruguay erste Infektionen mit dieser COVID-19-Linie.
- Im Februar 2021 kamen Argentinien, Bangladesch, Finnland, Frankreich, Indien, Irland, Kanada, Mexiko, Norwegen, Paraguay, Peru, Portugal, Schweden, Schweiz, Spanien, Suriname, Türkei, Venezuela hinzu.
- Im März 2021 traten die ersten Fälle dieser COVID-19-Linie in Aruba, Australien, Bolivien, Chile, Dänemark, Dominikanische Republik, Guadeloupe, Indien, Jordanien, Neuseeland, den Philippinen auf.
- Im April 2021 meldeten die Volksrepublik China, Israel, Malta, Österreich, Panama, Slowenien den ersten Fall mit dieser COVID-19-Variante[3].
Forschungsergebnisse
Aminosäureveränderungen mit Schwerpunkt Spike-Protein
Es wurden 17 Änderungen in der Aminosäuresequenz, 10 davon in dem Spikeprotein des Virus festgestellt. Sie unterscheidet sich vom Ursprungstyp durch die Änderungen der Aminosäuren des Spike-Proteins, Polymorphismen auf (L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, H655Y, T1027I, V1176F) und an der Spitze des Spike-Proteins (N501Y, K417T, E484K). Die Mutationen (K417T, E484K und N501Y) erhöhen die Bindung an den menschlichen ACE2-Rezeptor der Zellen. Das Ansteckungsrisiko ist um 1,4 bis 2,2-fache gegenüber der Ursprungsvariante erhöht. Man schätzt das Datum des ersten Auftritts dieser Mutationen zwischen dem 6. Oktober bis 24. November 2020. Ab Januar 2021 beobachtete man einen sprunghaften Anstieg der Covid-19-Todesfälle in Brasilien. Genaue Angaben zu erhöhter Sterblichkeit gegenüber der Ursprungsvariante von SARS-CoV-2 sind noch nicht vorhanden. Ob die derzeit verfügbaren Impfstoffe auch gegen diese Variante wirksam sind, wird noch untersucht. Zurzeit (Frühjahr 2021) werden vermehrte Zweit-Infektionen mit der Gamma-Variante bei überstandener Erstinfektion untersucht.
Mutationen
Bisher sind folgende durch nicht-synonyme Mutationen im Spike-Gen verursachten, für die Gamma-Variante charakteristischen Änderungen der Proteine identifiziert: ORF1ab des Virus:
- synT733C
- synC2749T
- S118L
- K1795Q
- del11288-11296 (3675- 3677 SGF)
- synC12778T
- synC138660T
- E5665D
Mutationen des Spike-Proteins des Virus:
- L18F
- T20N
- P26S
- D138Y
- R190S
- K417T
- E484K
- N501Y
- H655Y
- T1027I
- V1176F
ORF8 des Virus:
- E92K
- ins28269-28273
N des Virus:
- P80R
- RBD-Schlüsselpositionen des Virus
- K417
- E484
- N501
Verlust der Polymorphismen im Spike-Protein
- Deletion H69/V70
- Deletion 144
- N501Y
- A570D
- D614G
- P681H
- T716I
- S982A
- D118H
Unterschiede der Gamma-Variante (B.1.1.248) und (B.1.351)
Die Unterschiede befinden sich an der RBD-Schlüsselpositionen des Virus K417T wo das Protein Lysin an Position 417 durch Threonin ersetzt worden ist. E484K kann 90 % der Antikörper gegen das Virus neutralisieren. hACE2 erhöht die Wirksamkeit der Antikörperneutralisation des Virus weiter.[4]
Siehe auch
- Abschnitt Klassifizierung und Bezeichnung gemäß WHO im Artikel SARS-CoV-2, inklusive weiterer Varianten
Einzelnachweise
- ↑ ECDC: Data on SARS-CoV-2 variants in the EU/EEA. In: COVID-19 / Situation updates on COVID-19 / Download COVID-19 datasets. ecdc.europa.eu, 2. September 2021, abgerufen am 2. September 2021 (englisch, country=Germany, source=GISAID, variant=P.1 - verwendet Kalenderwoche: year_week=5 bis 33 -> Daten: percent_variant).
- ↑ Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings vom 13. Januar 2021 (engl.)
- ↑ P.1 2021-06-18 (engl.) vom 16.Juni 2021, abgerufen am 21. Juni 2021
- ↑ SARS-CoV-2: Virologische Basisdaten sowie Virusvarianten Abschnitt Gamma Gamma (P.1; 501Y.V3) auf der Webseite des bei Robert Koch Instituts
Weblinks
- P.1 – Description. In: cov-lineages.org. 6. Januar 2022, archiviert vom Original am 7. Januar 2022 (englisch, Komplett-Überblick Variante Gamma).
- Genomics and epidemiology of a novel SARS-Co2- line in Manaus, Brazil (engl.), abgerufen am 1. März 2021
- Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings, 12. Januar 2021 (engl.), abgerufen am 1. März 2021
- Neuartiges Coronavirus Virologische Basisdaten RKI vom 10. Februar 2021, abgerufen am 1. März 2021
- SARS-CoV-2: Virologische Basisdaten sowie Virusvarianten RKI vom 10. Februar 2021, abgerufen am 5. März 2021
- Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil vom 21. Mai 2021 (engl.), abgerufen am 25. Mai 2021
