Pardis C. Sabeti

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Pardis Christine Sabeti (2013)

Pardis Christine Sabeti (geboren am 25. Dezember 1975 in Tehran, Iran) ist eine iranisch-amerikanische Bioinformatikerin und medizinische Genetikerin. Sabeti ist ordentliche Professorin am Center for Systems Biology und dem Department of Organismic and Evolutionary Biology an der Harvard-Universität sowie im Department of Immunology and Infectious Disease der Harvard T.H. Chan School of Public Health[1] und ist Institutsmitglied am Broad Institute[2] sowie ein Howard Hughes Medical Institute Investigator. Sie ist Leiterin des Sabeti Labors.[3] Durch ihre Forschungsarbeiten zum Ebola-Virus-Ausbruch im Jahre 2014 wurde sie zu einer der Personen des Jahres im TIME Magazine (Ebola Fighters) und 2015 zu einer der einflussreichsten Personen der TIME 100 gewählt.

Karriere und Forschung

Als Doktorandin in Oxford und Postdoktorandin bei Eric Lander am Broad Institute entwickelte Sabeti eine Reihe statistischer Tests, die nach gemeinsamen genetischen Varianten suchen, die bei ungewöhnlich langen Haplotypen zu finden sind um positive Selektion zu identifizieren. Ihre Tests, Extended Haplotype Homozygosity (EHH), der Long Range Haplotype (LRH) Test und Cross Population Extended Haplotype Homozygosity (XP-EHH), sollen vorteilhafte Mutationen nachweisen, deren Häufigkeit in menschlichen Populationen in den letzten 10.000 Jahren rapide angestiegen ist.[4][5][6] Als Fakultätsmitglied an der Harvard-Universität haben Sabeti und ihre Gruppe einen statistischen Test entwickelt, um Auswahlsignale genau zu bestimmen, das Composite of Multiple Signals (CMS)[7] und eine Reihe statistischer Tests, um Korrelationen in Datensätzen jeglicher Art zu erkennen und zu charakterisieren, sogenannte „maximal information non-parametic exploration (MINE)“.

Sie entwickelte eine bioinformatische statistische Methode, die Teile des Genoms identifiziert, die den natürlichen Selektionsprozessen unterliegen und einen Algorithmus, der die genetischen Effekte auf die Entwicklung von verschiedenen Krankheiten erklärt[8]. Sie hat in ihrer wissenschaftlichen Karriere zu den verschiedensten Bereichen beigetragen – wie zum Beispiel zur Sequenzierung von Viren, zur Informationstheorie, zur Überwachung von Krankheiten und zu Aufklärungsbemühungen in Westafrika –, um umfassende Ansätze zur Erkennung, Eindämmung und Behandlung tödlicher Infektionskrankheiten zu entwickeln.[4][9][10]

Forschungen zum Ebola-Ausbruch in Westafrika 2014

Im Jahr 2014 gehörte Sabeti zu einem Team unter der Leitung von Christian Happi, einem kamerunischen Genetiker, der mithilfe fortschrittlicher Genomsequenzierungstechnologie einen einzelnen Infektionspunkt von einem Tierreservoir zu einem Menschen beim Ebola-Ausbruch in Westafrika identifizierte[11][12]. RNA-Veränderungen deuten darauf hin, dass auf die erste Infektion beim Menschen ausschließlich Übertragungen von Mensch zu Mensch folgten[13].

Weitere Aktivitäten

Sabeti ist Teilnehmerin der jährlichen Distinguished Lecture Series am renommierten Research Science Institute des MIT für Schüler. Im Mai 2015 hielt sie einen TED-Vortrag mit dem Titel „Wie wir das nächste tödliche Virus bekämpfen“.[14]

Sabeti ist ein World Economic Forum (WEF) Young Global Leader und ein National Geographic Emerging Explorer.[15]

Sabeti ist zudem die Leadsängerin der Rockband Thousand Days[16] und ist auch Moderatorin der von Annenberg Learner gesponserten Bildungsreihe „Against All Odds: Inside Statistics“.[17] Diese Show ist in vielen Lehrplänen für Highschool-Statistik enthalten.

Auszeichnungen

Weblinks

Commons: Pardis Sabeti – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

Einzelnachweise

  1. ↑ Pardis Sabeti. Abgerufen am 12. Dezember 2019 (amerikanisches Englisch).
  2. ↑ Pardis Sabeti. 6. Juli 2015, abgerufen am 12. Dezember 2019 (englisch).
  3. ↑ Sabeti Lab. Abgerufen am 12. Dezember 2019 (amerikanisches Englisch).
  4. ↑ a b Pardis C. Sabeti, David E. Reich, John M. Higgins, Haninah Z. P. Levine, Daniel J. Richter: Detecting recent positive selection in the human genome from haplotype structure. In: Nature. Band 419, Nr. 6909, Oktober 2002, ISSN 0028-0836, S. 832–837, doi:10.1038/nature01140 (Online [abgerufen am 12. Dezember 2019]).
  5. ↑ Sabeti, Pardis. In: The David and Lucile Packard Foundation. Abgerufen am 12. Dezember 2019 (amerikanisches Englisch).
  6. ↑ Iranian Scientist Wins NIH 2009 Innovator Award. Abgerufen am 12. Dezember 2019.
  7. ↑ Sharon R. Grossman, Ilya Shlyakhter, Ilya Shylakhter, Elinor K. Karlsson, Elizabeth H. Byrne: A composite of multiple signals distinguishes causal variants in regions of positive selection. In: Science (New York, N.Y.). Band 327, Nr. 5967, 12. Februar 2010, ISSN 1095-9203, S. 883–886, doi:10.1126/science.1183863, PMID 20056855.
  8. ↑ Pardis Sabeti. 6. Juli 2015, abgerufen am 12. Dezember 2019 (englisch).
  9. ↑ The International HapMap Consortium, Pardis C. Sabeti, Patrick Varilly, Ben Fry, Jason Lohmueller: Genome-wide detection and characterization of positive selection in human populations. In: Nature. Band 449, Nr. 7164, Oktober 2007, ISSN 0028-0836, S. 913–918, doi:10.1038/nature06250, PMID 17943131, PMC 2687721 (freier Volltext) – (Online [abgerufen am 12. Dezember 2019]).
  10. ↑ D. N. Reshef, Y. A. Reshef, H. K. Finucane, S. R. Grossman, G. McVean: Detecting Novel Associations in Large Data Sets. In: Science. Band 334, Nr. 6062, 16. Dezember 2011, ISSN 0036-8075, S. 1518–1524, doi:10.1126/science.1205438, PMID 22174245, PMC 3325791 (freier Volltext).
  11. ↑ Gina Kolata: The Virus Detectives. In: The New York Times. 1. Dezember 2014, ISSN 0362-4331 (Online [abgerufen am 12. Dezember 2019]).
  12. ↑ Daniel J. Park, Gytis Dudas, Shirlee Wohl, Augustine Goba, Shannon L. M. Whitmer: Ebola Virus Epidemiology, Transmission, and Evolution during Seven Months in Sierra Leone. In: Cell. Band 161, Nr. 7, 18. Juni 2015, ISSN 1097-4172, S. 1516–1526, doi:10.1016/j.cell.2015.06.007, PMID 26091036, PMC 4503805 (freier Volltext).
  13. ↑ Single animal to human transmission event responsible for 2014 Ebola outbreak. 20. Juli 2015, abgerufen am 12. Dezember 2019 (englisch).
  14. ↑ Pardis Sabeti: How we'll fight the next deadly virus. Abgerufen am 12. Dezember 2019 (englisch).
  15. ↑ Pardis Sabeti. 6. Juli 2015, abgerufen am 12. Dezember 2019 (englisch).
  16. ↑ Geniuses who will change your life - CNN.com. Abgerufen am 12. Dezember 2019.
  17. ↑ Resource: Against All Odds: Inside Statistics. Abgerufen am 12. Dezember 2019.
  18. ↑ National Academy of Medicine Elects 100 New Members. In: nam.edu. National Academy of Medicine, 19. Oktober 2020, abgerufen am 23. Oktober 2020 (englisch).
Personendaten
NAME Sabeti, Pardis C.
ALTERNATIVNAMEN Sabeti, Pardis Christine (vollständiger Name)
KURZBESCHREIBUNG iranisch-amerikanische Bioinformatikerin und medizinische Genetikerin
GEBURTSDATUM 25. Dezember 1975
GEBURTSORT Tehran, Iran
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