Alphaproteobacteria
| Alphaproteobacteria | ||||||||
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Agrobacterium tumefaciens (Rhizobiales) an einer Möhrenzelle (sekundärelektronenmikroskopisches Bild) | ||||||||
| Systematik | ||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||
| Alphaproteobacteria | ||||||||
| Garrity et al. 2006 |
Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet eine Klasse im phylogenetischen System der Bakterien, das auf der Grundlage der Basensequenz der ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören zum Stamm (Phylum) der Proteobacteria,
Systematik
Zu den Alphaproteobacteria gehören die Ordnungen[1]
- Caulobacterales Henrici & Johnson 1935
- Iodidimonadales Iino et al. 2016
- Kiloniellales Wiese et al. 2009
- Kordiimonadales Kwon et al. 2005
- Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
- Micropepsales Harbison et al. 2017
- Parvularculales Cho und Giovannoni 2003
- Rhizobiales Kuykendall 2006
- Rhodobacterales Garrity et al. 2006
- Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971
- Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
- Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
- Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006
sowie
- Pelagibacterales Grote et al. 2012[2]
- Holosporales Wang und Wu 2013; Martijn et al. 2018[3]
und zahlreiche, bisher nicht sicher eingeordnete Isolate.
Wichtige Vertreter sind unter anderem in den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella und Nitrobacter zu finden. Unter den Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien in Gewässerproben zeigen oft oligotrophe Verhältnisse an.
| Stammbaum der Alphaproteobacteria auf Basis ribosomaler RNA (rRNA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Kladogramm auf Basis des Vergleichs der 16S- und 23S-rRNA-Sequenzen. Ferla et al.[3] |
Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Ricketsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[4] und National Center for Biotechnology Information (NCBI)[5] sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts "The All-Species Living Tree"[6]) unter anderem:
- Sneathiellales mit Sneathiella chinensis, S. chungangensis, S. glossodoripedis (basal in Rickettsiales[7][8] oder zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013))
- Parvularculales mit Parvularcula bermudensis (nahe Rhodobacterales/Rhizobiales, Caulobacteridae)[9]
- Iodidimonadales mit Iodidimonas muriae[10] zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
- Kiloniellales mit Kiloniella laminarae zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
- Kordiimonadales mit Kordiimonas gwangyangensis[11] zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
- Micropepsales mit Micropepsis pineolensis (incerta sedis)[12]
- Rhodovibrio mit Rhodovibrio salinarum, R. sodomensis (Rhodospirillaceae, Caulobacteridae)[13]
- Micavibrio aeruginosavorus Kwon et al. 2005 (incerta sedis)
- Vibrio adaptatus und V. cyclosites (nach Muir et al. 1990 nicht Gattung Vibrio, sondern bisher nicht bezeichnete Gattung(en) der Alphaproteobacteria, incerta sedis)
- Furvibacter Lee et al. 2007
- Polymorphum gilvum Cai 2010
- Subaequorebacter tamlense Lee 2006[14]
- Tuberoidobacter mutans Nikitin 1983[15][16][17]
Quellen
- ↑ J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) - Class Alphaproteobacteria (Stand: 11. Januar 2019)
- ↑ Pelagibacterales, auf: NCBI Taxonomy Browser
- ↑ a b M. P. Ferla, J. C. Thrash, S. J. Giovannoni, W. M. Patrick: New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability. In: PLOS One. 8, Nr. 12, 2013, S. e83383. doi:10.1371/journal.pone.0083383. PMID 24349502. PMC 3859672 (freier Volltext).
- ↑ J.P. Euzéby: Alphaproteobacteria. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archiviert vom Original am 27. Januar 2013. Abgerufen am 26. April 2019.
- ↑ Sayers: Alphaproteobacteria. [National Center for Biotechnology Information] (NCBI) taxonomy database. Abgerufen am 26. April 2019.
- ↑ 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Abgerufen am 26. April 2019.
- ↑ Sneathiella, auf: LPSN
- ↑ Sneathiella glossodoripedis, auf: UniProt
- ↑ Jang-Cheon Cho, Stephen J. Giovannoni: Parvularcula bermudensis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium that forms a deep branch in the α-Proteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Band 53, Nr. 4, Juli 2003, S. 1031–1036, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.02566-0. PMID 12892122.
- ↑ Genus Iodidimonas, auf LPSN
- ↑ Order Kordiimonadales, auf LPSN
- ↑ Order Micropepsales, auf LPSN
- ↑ Rhodovibrio salinarum, auf: BacDive
- ↑ Subaequorebacter, auf: NCBI Taxonomy Browser
- ↑ Advances in Microbial Physiology, Vol. 24, Academic Press, 12. Juli 1983, ISBN 0-12-027724-7, S. 111
- ↑ Tuberoidobacter, on: IniProt Taxonomy
- ↑ Tuberoidobacter, auf: NCBI Taxonomy Browser
Literatur
- Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.) The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria. 7 Bände, 3. Auflage, Springer-Verlag, New York u. a. O., 2006, ISBN 0-387-30740-0. Vol. 5: Proteobacteria: Alpha and Beta Subclass ISBN 0-387-30745-1
