Pseudomonadota
| Proteobakterien | ||||||
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Citrobacter freundii (sekundärelektronenmikroskopisches Bild) | ||||||
| Systematik | ||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||
| Pseudomonadota | ||||||
| Garrity et al. 2021 |
Die Pseudomonadota (synonym Proteobacteria)[1][2] stellen eine der größeren als Abteilungen oder als Stämme (im Sinne von Phylum) angesehenen Gruppen der Domäne der Bakterien dar. Zu ihnen gehören viele wichtige stickstofffixierende Bakterien und Krankheitserreger.
Der Name Proteobacteria ist vom griechischen Gott Proteus abgeleitet, der seine Form wechseln konnte, und bezieht sich auf die Vielfalt von Formen in dieser Gruppe. Sie ist daher nicht morphologisch, sehr wohl aber durch verwandte RNA-Sequenzen definiert. Die Zellwände der Proteobacteria bestehen insbesondere aus ein- bis wenigschichtigem Murein und Lipopolysacchariden, daher sind sie gramnegativ. Einige Arten reagieren allerdings auch gram-variabel, wie z. B. Azospirillum brasilense und Arten von Methylobacterium. Viele Arten besitzen Geißeln, andere sind in der Lage, zu gleiten.
Einige Untergruppen wie die Rhodospirillaceae (Purpurbakterien) und Chromatiaceae (Schwefel-Purpurbakterien) sind in der Lage, unter anoxischen Bedingungen anoxygene Photosynthese zu betreiben. Sie benutzen dafür organische Stoffe, Schwefelwasserstoff, Schwefel oder Wasserstoff als Elektronen-Donor und produzieren daher keinen elementaren Sauerstoff.
Die Untergruppe der Myxobacteria steht bisher als einzige bekannte Gruppe von Proteobakterien im Übergangsfeld zwischen einzelliger und mehrzelliger Lebensweise. Myxobakterien bilden vielzellige Fruchtkörper mit Sporen, eine Konvergenz zu den Schleimpilzen.
Die Proteobacteria waren zunächst in fünf Hauptgruppen eingeteilt, die als Klasse angesehen wurden, und die griechischen Buchstaben Alpha bis Epsilon als Präfix erhielten: Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria und Epsilonproteobacteria. Im Laufe der Zeit sind vier weitere Klassen beschrieben worden (Stand 2020), die „Zetaproteobacteria“, Acidithiobacillia, Hydrogenophilalia und Oligoflexia.[3]
Die Mitochondrien der Eukaryonten, aller Lebewesen mit einem Zellkern, stammen möglicherweise von endosymbiontischen Proteobakterien ab (Siehe: Endosymbiontenhypothese).
Systematik
Im Folgenden werden einige wichtige Ordnungen, Familien und Gattungen der acht Klassen der Proteobakterien aufgeführt. Der Artikel Systematik der Bakterien gilt in der Wikipedia als Referenz und enthält eine größere Auswahl an Taxa im Phylum Proteobacteria.
Acidithiobacillia
- Ordnung I. Acidithiobacillales[4]
- Familie Acidithiobacillaceae
- Genus Acidithiobacillus
- Familie Thermithiobacillaceae
- Genus Thermithiobacillus
Alphaproteobacteria
- Ordnung I. Rhodospirillales
- Familie I. Rhodospirillaceae (nicht Schwefel verarbeitende Purpurbakterien)
- Familie II Acetobacteraceae; triv. Essigsäurebakterien (Essig)
- Ordnung II. Rickettsiales
- Ordnung VI. Rhizobiales
- Familie I. Rhizobiaceae
- Genus I. Rhizobium
- Familie II. Bartonellaceae
- Familie III. Brucellaceae
- und andere Taxa
Betaproteobacteria
- Ordnung I. Burkholderiales
- Ordnung IV. Neisseriales
- Familie I. Neisseriaceae
- und andere Taxa
Gammaproteobacteria
- Ordnung I. Chromatiales
- Familie I. Chromatiaceae (triv. Schwefel-Purpurbakterien)
- Familie II. Ectothiorhodospiraceae
- Ordnung II. „Xanthomonadales“
- Familie I. „Xanthomonadaceae“
- Genus I. Xanthomonas
- Genus VII. Stenotrophomonas
Innerhalb vom LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature), eine wichtige Auflistung der Systematik der Bakterien, wird die Ordnung Xanthomonadales nicht mehr aufgeführt.[3] Diese Ordnung und die einzige zugestellte Familie Xanthomonadaceae wurden aufgrund neuerer Untersuchungen aufgelöst.[5] Viele der Gattungen werden nun zu der Ordnung Lysobacterales gestellt, andere werden noch keiner speziellen Ordnung zugeordnet. Allerdings ist die alte Systematik durchaus noch in Gebrauch und wird so z. B. in der Taxonomiedatenbank des NCBI (National Center for Biotechnology Information), eine wichtige Quelle für Informationen zu Bakterien, auch noch genutzt.
- Ordnung IV. Thiotrichales
- Familie I. Thiotrichaceae
- Genus VII. Thiomargarita
- Ordnung VIII. Pseudomonales
- Familie I. Pseudomonaceae
- Genus I. Pseudomonas
- Familie II. Moraxellaceae
- Genus I. Moraxella
- Genus II. Acinetobacter
- Ordnung X. „Vibrionales“
- Familie I. Vibrionaceae
- Genus I. Vibrio
- Ordnung XII. Enterobacterales, zuvor als Ordnung „Enterobacteriales“ bezeichnet[6]
- Familie Budviciaceae
- Familie Enterobacteriaceae
- Familie Erwiniaceae
- Familie Hafniaceae
- Familie Morganellaceae
- Familie Pectobacteriaceae
- Familie Thorselliaceae
- Familie Yersiniaceae
- Ordnung XIII. Pasteurellales
- Familie I. Pasteurellaceae
- Genus I. Pasteurella
- Genus III. Haemophilus
- Ordnung XIV. Oceanospirillales
- Familie I. Alcanivoracaceae
- Familie II. Hahellaceae
- Familie III. Halomonadaceae
- Genus I. Halomonas
- Familie IV. Litoricolaceae
- Familie V. Oceanospirillacae
- Familie VI. Oleiphilaceae
- Familie VII. „Saccharospirillaceae“
- und andere Taxa
Hydrogenophilalia
- Ordnung I. Hydrogenophilales
- Familie Hydrogenophilaceae
- mit nur einer Gattung, Hydrogenophilus
Deltaproteobacteria
- Ordnung I. Desulfovibrionales
- Familie I. Desulfovibrionaceae
- Genus Desulfovibrio
- Ordnung II. Myxococcales (Myxobakterien)
- Familie Myxococcaceae
- Ordnung Bdellovibrionales
- Familie Bdellovibrionaceae
- Genus Bdellovibrio
- und andere Taxa
Epsilonproteobacteria
- Ordnung Campylobacterales
- Familie Campylobacteraceae
- Genus Campylobacter
- Familie Helicobacteraceae
- Genus Helicobacter
- Ordnung Nautiliales
- Familie Nautiliaceae
- Genus Nautilia
- und andere Taxa
Oligoflexia
- Ordnung I. Oligoflexales[7]
- Familie Oligoflexaceae
- Genus Oligoflexus
- Ordnung II. Silvanigrellales[8]
- Silvanigrellalaceae
- Genus Silvanigrella
„Zetaproteobacteria“
- Familie „Mariprofundaceae“, mit der einzigen Gattung Mariprofundus[9]
Quellen
Literatur
- Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.): The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria. 7 Bände, 3. Auflage, Springer-Verlag, New York u. a. O., 2006, ISBN 0-387-30740-0. Vol. 5: Proteobacteria: Alpha and Beta Subclass ISBN 0-387-30745-1; Vol. 6: Proteobacteria: Gamma Subclass ISBN 0-387-30746-X; Vol. 7: Proteobacteria: Delta and Epsilon Subclass, ISBN 0-387-30747-8
- George M. Garrity, Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley (Hrsg.): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 2: The Proteobacteria, Part B: The Gammaproteobacteria. 2. Auflage. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-95040-2, doi:10.1007/0-387-28022-7.
- George M. Garrity, Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley (Hrsg.): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 2: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. 2. Auflage. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-24145-6, doi:10.1007/0-387-29298-5.
Einzelnachweise
- ↑ Aharon Oren, George M. Garrity: Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. In: Int. J. of Systematic And Evolutionary Microbiology (IJSEM), Band 71, Nr. 10, 25. Oktober 2021; doi:10.1099/ijsem.0.005056.
- ↑ LPSN: Phylum Pseudomonadota Garrity et al. 2021, List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature.
- ↑ a b Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria). In: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Abgerufen am 20. Dezember 2019.
- ↑ K. P. Williams, D. P. Kelly: Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nr. 63, August 2013, S. 2901–2906, doi:10.1099/ijs.0.049270-0.
- ↑ B. J. Tindall: The family name Solimonadaceae Losey et al. 2013 is illegitimate, proposals to create the names ‘Sinobacter soli’ comb. nov. and ‘Sinobacter variicoloris’ contravene the Code, the family name Xanthomonadaceae Saddler and Bradbury 2005 and the order name Xanthomonadales Saddler and Bradbury 2005 are illegitimate and notes on the application of the family names Solibacteraceae Zhou et al. 2008, Nevskiaceae Henrici and Johnson 1935 (Approved Lists 1980) and Lysobacteraceae Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) and order name Lysobacteriales Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) with respect to the classification of the corresponding type genera Solibacter Zhou et al. 2008, Nevskia Famintzin 1892 (Approved Lists 1980) and Lysobacter Christensen and Cook 1978 (Approved Lists 1980) and importance of accurately expressing the link between a taxonomic name, its authors and the corresponding description/circumscription/emendation In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB) Band 64, S. 293–297. DOI:10.1099/ijs.0.057158-0
- ↑ M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, R. S. Gupta: Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nr. 66, Dezember 2016, S. 5575–5599, doi:10.1099/ijsem.0.001485.
- ↑ R. Nakai, M. Nishijima, N. Tazato, Y. Handa, F. Karray, S. Sayadi, H. Isoda, T. Naganuma: Oligoflexus tunisiensis gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, filamentous bacterium of a novel proteobacterial lineage, and description of Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. nov. and Oligoflexia classis nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nr. 64, Oktober 2014, S. 3353–3359, doi:10.1099/ijs.0.060798-0.
- ↑ Martin W. Hahn, Johanna Schmidt, Ulrike Koll, Manfred Rohde, Susanne Verbarg, Alexandra Pitt, Ryosuke Nakai, Takeshi Naganuma, Elke Lang: Silvanigrella aquatica gen. nov., sp. nov., isolated from a freshwater lake, description of Silvanigrellaceae fam. nov. and Silvanigrellales ord. nov., reclassification of the order Bdellovibrionales in the class Oligoflexia, reclassification of the families Bacteriovoracaceae and Halobacteriovoraceae in the new order Bacteriovoracales ord. nov., and reclassification of the family Pseudobacteriovoracaceae in the order Oligoflexales. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nr. 67, August 2017, S. 2555–2568, doi:10.1099/ijsem.0.001965.
- ↑ David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan, Craig L. Moyer, Anna-Louise Reysenbach: A Novel Lineage of Proteobacteria Involved in Formation of Marine Fe-Oxidizing Microbial Mat Communities. In: PLoS ONE. Band 2, Nr. 8, August 2007, S. e667, doi:10.1371/journal.pone.0000667.
Weblinks
- Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria). In: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Abgerufen am 20. Dezember 2019.
- Tree of Life Web Project - Proteobacteria
