Flaviviridae
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Flaviviridae
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Die Flaviviridae stellen eine Familie von Viren dar, die alle einsträngige RNA enthalten und daher taxonomisch den RNA-Viren zugeordnet werden. Die Typspezies der gesamten Familie ist das Gelbfieber-Virus (daher auch der Name der Familie von lat. flavus, „gelb“).
Alle Vertreter dieser Familie besitzen eine Virushülle aus Lipiden der ursprünglichen Wirtszelle und darin eingelagerten viralen Proteinen und haben eine Größe zwischen 40 und 60 nm. Die Viren vermehren sich im Cytoplasma der Wirtszelle und sind im pH-Wert-Bereich von 7 bis 9 stabil.
Systematik
Innere Systematik
Zur Familie Flaviviridae zählen die Gattungen Flavivirus, Hepacivirus, Pegivirus und Pestivirus (International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), Stand November 2018). Die folgende Liste erhebt keinen Anspruch auf Vollständigkeit der aufgeführten Spezies, Details finden sich ggf. Bei den einzelnen Gattungen.
- Familie Flaviviridae
- Gattung Flavivirus (früher Arbovirus B)
- Die Erreger der Gattung Flavivirus rufen sowohl beim Menschen als auch beim Tier eine große Anzahl an Virusinfektionen hervor.
- Spezies Yellow fever virus (Gelbfieber-Virus, YFV, Typusspezies) – Gelbfieber
- Spezies Dengue virus (Dengue-Virus, DENV) – Dengue-Fieber
- Spezies Tick-borne encephalitis virus (FSME-Virus, TBEV) – Frühsommer-Meningoenzephalitis (FSME, englisch: TBE – tick-borne encephalitis)
- Spezies Japanese encephalitis virus (JEV) – Japanische B-Enzephalitis (Vögel und Schweine)
- Spezies Louping ill virus (Louping-ill-Virus, LIV) – Louping Ill
- Spezies Usutu virus (Usutu-Virus, USUV) – bei Vögeln ist die Infektion oft tödlich, beim Menschen geringe oder keine Symptome
- Spezies Wesselsbron virus (WSLV) – Wesselsbron-Krankheit (Schafe, Ziegen u. ä.)
- Spezies West Nile virus (West-Nil-Virus, WNV) – West-Nil-Fieber
- Spezies Zika virus (Zika-Virus, ZIKV) – Zika-Fieber
- Spezies Gadgets Gully virus (Gadgets-Gully-Virus, GGYV) – bei Großpinguinen (Königspinguin, Kaiserpinguin), ohne bekannte Symptome
- Gattung Hepacivirus
- Spezies Hepacivirus A
- Spezies Hepacivirus B (GB-Virus B, GBV-B)
- Spezies Hepacivirus C (Hepatitis-C-Virus, HCV, Typusspezies) – bedeutendster Vertreter, ruft beim Menschen die Krankheit Hepatitis C hervor
- Spezies Hepacivirus D bis N
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- Spezies Pegivirus A (GB-Virus A, GBV-A, Typusspezies), befällt Neuweltaffen
- Spezies Pegivirus B (GB-Virus D, GBV-D)
- Spezies Pegivirus C (GB-Virus C, GBV-C, veraltet Human pegivirus, HPgV und Hepatitis-G-Virus, HGV; mit Subspezies GB-Virus Citro, GBV-Citro)
- Spezies Pegivirus D bis Pegivirus G
- Spezies Pegivirus H (alias Human hepegivirus, HHPgV oder HPgV-2)
- Spezies Pegivirus I bis Pegivirus K
- Gattung Pestivirus[4]
- Die Viren der Gattung Pestivirus spielen ausschließlich bei Tieren als Krankheitserreger eine Rolle.
- Spezies Pestivirus A (Bovines Virusdiarrhoe-Virus 1, BVD/MD-Virus-1, BVDV-1, Typusspezies) – Erreger der BVD (Bovine Virusdiarrhoe)
- Spezies Pestivirus B (Bovines Virusdiarrhoe-Virus 2, BVD/MD-Virus-2, BVDV-2) – dito
- Spezies Pestivirus C (Klassisches Schweinepest-Virus, SP-Virus, en. früher Classical swine fever virus, CSFV, oderHog cholera virus) – Auslöser der Klassischen Schweinepest
- Spezies Pestivirus D (Border-Disease-Virus, BDV) – Verursacher von Border Disease bei Schafen.
- Spezies Pestivirus E
- Spezies Pestivirus F (Porcines Pestivirus, PPeV)
- Spezies Pestivirus G (Giraffen-Pestivirus, GPeV)
- Spezies Pestivirus H
- Spezies Pestivirus I
- Spezies Pestivirus J (Ratten-Pestivirus, RPeV)
- Spezies Pestivirus K (Atypisches Porcines Pestivirus, APPeV)
- Gattung „Jingmenvirus“ (Vorschlag)[5]
- Spezies „Mogiana tick virus“[6] („Jingmen tick virus“ (JMTV)[5][7])
-
- Spezies „Cuacua virus“
- Spezies „Donggang virus“
- Spezies „Karumba virus“ (KRBV)
- Spezies „Hanko virus“
- Spezies „Haslams Creek virus“
- Spezies „Mac Peak virus“ (McPV)
- Spezies „Marisma mosquito virus“
- Spezies „Menghai flavivirus“
- Spezies „Nakiwogo virus“ (NAKV)
- Spezies „Xishuangbanna Aedes flavivirus“
Äußere Systematik
Koonin et al. (2015) vermuten, dass die Flaviviridae Ursprung der von ihnen postulierten Verwandtschaftsgruppe Negative-strand RNA viruses sind; diese Gruppe entspricht dem heutigen Phylum Negarnaviricota. Vorschlagsgemäße Schwestergruppe wäre danach die Familie der Tombusviridae. Alle zusammen bilden sie nach diesem Vorschlag die von den Autoren postulierte Supergruppe „Flavivirus-like superfamily“.[9][10] Shi et al. (2016) bezeichnen die weitere Verwandtschaft der Flaviviridae ähnlich als „Flavi-like viruses“ und haben dazu eine Reihe von Kandidaten gefunden:[11]
- Spezies „Beihai barnacle virus 1“ (BHBV1)
- Spezies „Bole tick virus 4“ (BLTV4)[12]
- Spezies „Gamboa mosquito virus“ (GMV)[13]
- Spezies „Sanxia water strider virus 6“ (SXWSV6)[14]
- Spezies „Shayang fly virus 4“ (SYFV4)[15]
- Spezies „Shayang spider virus 4“ (SYSV4)[16]
- Spezies „Shuangao lacewing virus 2“ (SALV2)[17]
- Spezies „Tacheng tick virus 8“ (TCTV8)[18]
- Spezies „Wuhan centipede virus“ (WHCeV)[19]
- Spezies „Xingshan cricket virus“ (XSCV)[20]
- Spezies „Xinzhou spider virus 2“ (XZSV2)[21]
- Spezies „Xinzhou spider virus 3“ (XZSV3)[22]
Das ICTV hat im März 2020 Mit der
#35[23] die Tymovirales, die Flaviviridae, die Tombusviridae und eine Reihe anderer Familien in das gemeinsame Phylum Kitrinoviricota gestellt, und dieses u. a. mit den Negarnaviricota in das gemeinsame Reich Orthornavirae.[1][24][25]
Ein Kladogramm dieser Gruppen findet sich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.
Einzelnachweise
- ↑ a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Yellow fever virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
- ↑ ICTV: Positive-sense RNA Viruses: Flaviviridae, Genus: Pegivirus, 2019
- ↑ Positive-sense RNA Viruses > Flaviviridae – Genus: Pestivirus, in: 10th Report of the ICTV, 2017
- ↑ a b Xin-Cheng Qin et al.: A tick-borne segmented RNA virus contains genome segments derived from unsegmented viral ancestors. In: PNAS Band 111, Nr. 18, 6. Mai 2014, S. 6744–6749, doi:10.1073/pnas.1324194111
- ↑ NCBI Taxonomy Browser:: Mogiana tick virus (species)
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Jingmen tick virus (no rank)
- ↑ NCBI: unclassified Flaviviridae
- ↑ Da diese Supergruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Nagarnaviricota ein Phylum enthält, muss ihr Rang notwendigerweise höher sein und ist nicht als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung (wie z. B. Phylum) waren zum Zeitpunkt der 2015-er Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
- ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology. Epub 12. März 2015, Mai 2015, 2–25, S. 479-480 PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806.
- ↑ Mang Shi, Xian-Dan Lin, Nikos Vasilakis, Jun-Hua Tian, Ci-Xiu Li, Liang-Jun Chen, Gillian Eastwood, Xiu-Nian Diao, Ming-Hui Chen, Xiao Chen, Xin-Cheng Qin, Steven G Widen, Thomas G Wood, Robert B Tesh, Jianguo Xu, Edward C Holmes, Yong-Zhen Zhang: Divergent Viruses Discovered in Arthropods and Vertebrates Revise the Evolutionary History of the Flaviviridae and Related Viruses. In: Journal of Virology. 90, Nr. 2, 2016, S. 659–69. doi:10.1128/JVI.02036-15. PMID 26491167. PMC 4702705 (freier Volltext).
- ↑ NCBI: Bole tick virus 4 (species)
- ↑ NCBI: Gamboa mosquito virus (species)
- ↑ NCBI: Sanxia water strider virus 6 (species)
- ↑ NCBI: Shayang fly virus 4 (species)
- ↑ NCBI: Shayang spider virus 4 (species)
- ↑ NCBI: Shuangao lacewing virus 2 (species)
- ↑ NCBI: Tacheng tick virus 8 (species)
- ↑ NCBI: Wuhan centipede virus (species)
- ↑ NCBI: Xingshan cricket virus (species)
- ↑ NCBI: Xinzhou spider virus 2 (species)
- ↑ NCBI: Xinzhou spider virus 3 (species)
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Carrot mottle mimic virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Akabane orthobunyavirus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
