Organic-Lake-Virophage
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||
“Organic Lake virophage”
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| Kurzbezeichnung | ||||||
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Der „Organic-Lake-Virophage“ (wissenschaftlich „Organic Lake virophage“, OLV) ist ein doppelsträngiger DNA-Virophage, d. h. ein Virus, für dessen Replikation die Anwesenheit eines anderen Virus (Helfervirus) erforderlich ist, wobei die Replikationsfähigkeit dieses anderen Virus eingeschränkt wird. Er wurde metagenomisch in Proben aus dem Organic Lake in der Antarktis nachgewiesen.[2]
Mit Stand März 2019 ist der OLV nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) registriert.[3] Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) versteht das OLV als eine unbestätigte Virusspezies in der Familie Lavidaviridae, zu der auch die vom ICTV bestätigten Gattungen Sputnikvirus (mit den Spezies Sputnik-Virophage und Zamilona-Virophage) und Mavirus gehören.[4]
Aufbau
Die Virionen (Viruspartikel) von OLV scheinen einen Durchmesser von ca. 100 nm zu haben und umhüllt zu sein. Das Genom besteht aus doppelsträngiger DNA und hat eine Länge von 26.421 bp. Es kodiert 38 Proteine. Dazu gehören das Hüllprotein (englisch major coat protein), eine DNA-Packaging-ATPase, eine mutmaßliche DNA-Polymerase/Primase und eine N6-Adenin-spezifische DNA-Methyltransferase.[2]
Vermehrung
OLV parasitiert vermutlich Organic-Lake-Phycodnaviren (OLPV), die weniger zu den Phycodnaviridae als vielmehr zu den erweiterten Mimiviridae (d. h. der Ordnung Imitervirales[1]) gehören[5][6] (Gruppe III: vorgeschlagene Schwesterfamilie „Mesomimiviridae“ um die „OLPG“-Gruppe).[7][8]
Systematik
Für die Systematik der Lavidaviridae mit OLV, Sputnikvirus (mit Sputnik- und Zamilon-Virophagen), „Yellowstone-Lake-Virophage 1“ bis „7“ (YSLV1 bis YSLV7) und „Dishui-Lake-Virophage 1“ (DSLV1) wurden Verschiedene Vorschläge gemacht, etwa von Gong et al. (2016), Fig. 5,[9] oder von Krupovic et al. (2016), Fig. 4.[10]
Einzelnachweise
- ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b S. Yau, F. M. Lauro, M. Z. Demaere, M. V. Brown, Thomas first5=T., M. J. Raftery, C. Andrews-Pfannkoch, M. Lewis, J. M. Hoffman, J. A. Gibson, R. Cavicchioli: Virophage control of antarctic algal host-virus dynamics. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 108, Nr. 15, April 2011, S. 6163–6168. bibcode:2011PNAS..108.6163Y. doi:10.1073/pnas.1018221108. PMID 21444812. PMC 3076838 (freier Volltext).
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2018b.v2 MSL #34v vom März 2019
- ↑ NCBI: Organic Lake virophage
- ↑ Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Natalya Yutin: Evolution of double-stranded DNA viruses of eukaryotes: From bacteriophages to transposons to giant viruses, in: ResearchGate Literature Review, Februar 2015, doi: 10.1111/nyas.12728, Figure 3
- ↑ Blog of Carolina Reyes, Kenneth Stedman: Are Phaeocystis globosa viruses (OLPG) and Organic Lake phycodnavirus a part of the Phycodnaviridae or Mimiviridae?, on ResearchGate, Jan. 8, 2016
- ↑ Weijia Zhang, Jinglie Zhou, Taigang Liu, Yongxin Yu, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes In: Scientific Reports, 5, Nr. 15131 (2015), doi:10.1038/srep15131
- ↑ Virus-Host DB: Yellowstone lake mimivirus
- ↑ Chaowen Gong, Weijia Zhang, Xuewen Zhou, Hongming Wang, Guowei Sun, Jinzhou Xiao, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Novel Virophages detected in a Freshwater Lake in China. In: Front. Micribiol., 22. Januar 2016, doi:10.3389/fmicb.2016.00005
- ↑ Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Matthias G. Fischer: A classification system for virophages and satellite viruses, in: Archives of Virology, Januar 2016, Band 161, Nr. 1, S. 233–247, doi:10.1007/s00705-015-2622-9
Weblinks
- Organic Lake virophage. In: NCBI Taxonomy Browser. 938080.
- J. Zhou, W. Zhang, S. Yan, J. Xiao, Y. Zhang, B. Li, Y. Pan, Y. Wang: Diversity of virophages in metagenomic data sets. In: Journal of Virology. Band 87, Nummer 8, April 2013, S. 4225–4236, doi:10.1128/JVI.03398-12, PMID 23408616, PMC 3624350 (freier Volltext).
- Meriem Bekliz, Philippe Colson, Bernard La Scola; Eric O. Freed (Hrsg.): The Expanding Family of Virophages, in: Viruses v.8(11); November 2016, PMC 5127031 (freier Volltext), PMID 27886075, doi:10.3390/v8110317
