Verstraetearchaeota
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||
| Verstraetearchaeota | ||||||||||
| Vanwonterghem et al. 2016 |
„Verstraetearchaeota“ ist ein vorgeschlagenes Kandidatenphylum der Archaeen. Die Vertreter dieser Gruppe leben in anoxischen (sauerstofffreien) Umgebungen mit hohen Methanflüssen (Methandurchsatz), ähnlich wie einige „Bathyarchaeota“.[1]
Das Genom dieser Archaeen kodiert die Gene, die für die methylotrophe Methanogenese benötigt werden, und könnten Energie durch einen ähnlichen Mechanismus erhalten, wie er für die obligat H2-abhängigen methylotrophen „Methanomassiliicoccales“ (Thermoplasmata)[2] und die „Methanofastidiosa“ (alias Arc I Gruppe oder WSA2 Gruppe; zu Euryarchaeota, siehe Methanbildner, Methanogenese)[3] vorgeschlagen wurde. „Verstraetearchaeota“ und „Bathyarchaeota“ zeigen, dass die Methanogenese nicht nur bei Euryarchaeota vorkommt und somit ein älterer Stoffwechsel ist als ursprünglich erwartet.[4]
Etymologie
Die Bezeichnung „Verstraetearchaeota“ wurde vorgeschlagen in Anerkennung der Beiträge von Professor Willy Verstraete (
der Universität Gent, Belgien) zur Entwicklung und Anwendung von technischen mikrobiellen Ökosystemen (z. B. anaerobe Fermenter).[5]
Systematik
Systematik gemäß
der Phyla „Verstraetearchaeota“[6]
und „Nezhaarchaeota“ Wang et al. 2019:[7]
- Superphylum „TACK“
- Phylum: „Nezhaarchaeota“
- ohne nähere Klassifizierung:
- Spezies: „Candidatus Nezhaarchaeota archaeon WYZ-LMO7“
- Spezies: „Candidatus Nezhaarchaeota archaeon WYZ-LMO8“
- Phylum: „Verstraetearchaeota“
- Klasse: „Methanomethylia“
- Ordnung: „Methanomethyliales“
- Familie „Methanomethyliaceae“
- Gattung: „Candidatus Methanomethylicus“
- Spezies: „Candidatus Methanomethylicus mesodigestum“
- Spezies: „Candidatus Methanomethylicus oleusabulum“
- Gattung: „Candidatus Methanosuratus“
- Spezies: „Candidatus Methanosuratus petracarbonis“
- Spezies: „Candidatus Methanosuratus subterraneum“
- ohne Gattungszuweisung
- Spezies: „Candidatus Methanomethyliales bacterium“
- ohne Ordnungszuweisung
- Spezies: „Candidatus Methanomethylia archaeon“
- ohne Zuweisung zur Klasse „Methanomethylia“
- Spezies: „Candidatus Verstraetearchaeota archaeon UBA156“
- Spezies: „Candidatus Verstraetearchaeota archaeon UBA76“
Eine alternative Sichtweise mit Bezug auf Gemeinsamkeiten dieser beiden Kladen fasst beide Phyla zusammen als Phylum „Verstraetearchaeota“ (sensu lato) bzw. Klasse „Methanomethylicia“ Oren et al., 2020 (GTDB release 05-RS95)[8][9][10] (gegenüber „Methanomethylia“ Vanwonterghem et al. 2016)
- Superphylum „TACK“
- Phylum: „Verstraetearchaeota“ (s. l.)
- Klasse: „Methanomethylicia“
- Ordnung: „Nezhaarchaeales“ (mit WYZ-LMO7, WYZ-LMO8 — d. h. alle „Nezhaarchaeaota“ wie oben)
- Ordnung: „Methanomethylicales“ (mit bisheriger Klasse „Methanomethylia“; sowie UBA156, UBA76 — alle „Verstraetearchaeota“ s. s. wie oben)
- Klade B29-G17
Einzelnachweise
- ↑ Cindy J. Castelle, Jillian F. Banfield: Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life, in: Cell Perspective, Band 172, Nr. 6, S. 1181–1197, 8. März 2018, doi:10.1016/j.cell.2018.02.016
- ↑ NCBI: Methanomassiliicoccales(order)
- ↑ NCBI: Candidatus Methanofastidiosa (class)
- ↑ Inka Vanwonterghem, Paul N. Evans, Donovan H. Parks, Paul D. Jensen, Ben J. Woodcroft, Philip Hugenholtz, Gene W. Tyson: Methylotrophic methanogenesis discovered in the archaeal phylum Verstraetearchaeota, in: Nat Microbiol Band 1, Nr. 16170, 3. Oktober 2016, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.170
- ↑ LPSN: Phylum "Candidatus Verstraetearchaeota"
- ↑ NCBI: Candidatus Verstraetearchaeota (tree), "Candidatus Verstraetearchaeota" Vanwonterghem et al. 2016 (phylum); graphisch: Candidatus Verstraetearchaeota, auf: Lifemap, NCBI Version.
- ↑ NCBI: Candidatus Nezhaarchaeota (tree), Nezhaarchaeota Wang et al. 2019 (phylum); graphisch: Candidatus Nezhaarchaeota, auf: Lifemap, NCBI Version.
- ↑ K Mendler, H Chen, D. H. Parks, L. A. Hug, A. C. Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research 47. 2019, S. 4442–4448. doi:10.1093/nar/gkz246.
- ↑ Suzanna L. Bräuer, Nathan Basiliko, Henri M. P. Siljanen, Stephen H. Zinder: Methanogenic archaea in peatlands, in: FEMS Microbiology Letters, Band 367, Nr 20, 17. Oktober 2020, fnaa172, doi:10.1093/femsle/fnaa172
- ↑ Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrian A. Davin, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: Resolving widespread incomplete and uneven archaeal classifications based on a rank-normalized genome-based taxonomy, Preprint auf: CSH bioRχiv vom 17. Februar 2021, doi:10.1101/2020.03.01.972265
