Vorlage:Infobox Virus/Doku
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Alle Parameter:
Nur die wichtigsten Parameter:
Parameter
Parameter | Beschreibung | Möglicher Wert / Mögliche Werte |
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Name | Deutscher Name des Virustaxons/Virus | Nanoviriden / Gelbfieber-Virus / Bakteriophage T2
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Wiss_Name | Wissenschaftlicher Name, wenn möglich nach ICTV (ersatzweise nach NCBI), normalerweise kursiv und in englischer Sprachumgebung; Standardwert ist der niedrigste spezifizierte Rang (standardmäßig automatisch kursiv) | Yellow fever virus / Enterobacteria phage T2 / nicht festgelegt
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Wiss_KurzName | Wissenschaftlicher Kurzname, wenn möglich nach ICTV | YFV
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Bild | Bild (ggf. Schemazeichnung) eines (Mitglieds-)Virus | VirusBild.jpg
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Bild_größe | Größe des Bildes | 250px (Standardwert: 200px)
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Bild_legende | Legende des Bildes (ohne: keine Legende) | ohne / [[Virion|Virusteilchen]] von X (Standardwert: Name)
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Klassifikation | Klassifikation (optional, wird automatsch querverwiesen) | Viren (Standardwert) / Viroide / Satelliten / Viriforme
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ohne_Rang | nur für unbestätigte Verwandtschaftsgruppen: Ersetzt die Bezeichnungen für die gelisteten Ränge (etwa Unterart/Subspezies, Untergattung/Subgattung, …) durch den Text ‚ohne Rang‘ |
Rang / Rang1, Rang2,… / (Standardwert: leer)
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Realm | Realm (automatisch kursiv) | Realm / [[Realm]] / nicht klassifiziert
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Subrealm | Subrealm (automatisch kursiv) | Subrealm / [[Subrealm]] / nicht klassifiziert
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Reich | Reich (automatisch kursiv) | Reich / [[Reich]] / nicht klassifiziert
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Subreich | Unterreich (wird automatisch kursiv) | Subreich / [[Subreich]] / nicht klassifiziert
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Phylum | Phylum (automatisch kursiv) | Phylum / [[Phylum]] / nicht klassifiziert
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Subphylum | Subphylum (automatisch kursiv) | Subphylum / [[Subphylum]] / nicht klassifiziert
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Klasse | Klasse (automatisch kursiv) | Klasse / [[Klasse]] / nicht klassifiziert
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Subklasse | Unterklasse (automatisch kursiv) | Subklasse / [[Subklasse]] / nicht klassifiziert
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Ordnung | Ordnung (automatisch kursiv) | Ordnung / [[Ordnung]] / nicht klassifiziert
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Subordnung | Unterordnung (automatisch kursiv) | Subordnung / [[Subordnung]] / nicht klassifiziert
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Familie | Familie (automatisch kursiv) | Familie / [[Familie]] / nicht klassifiziert
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Subfamilie | Unterfamilie (automatisch kursiv) | Subfamilie / [[Subfamilie]] / nicht klassifiziert
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Gattung | Genus (Gattung) (automatisch kursiv) | Gattung / [[Gattung]] / nicht klassifiziert
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Subgattung | Subgenus (Untergattung) (automatisch kursiv) | Subgattung / [[Subgattung]] / nicht klassifiziert
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Spezies | Spezies (Art) (automatisch kursiv) | Spezies / [[Spezies]]
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Subspezies | Subspezies/Unterart (standardmäßig automatisch kursiv) | Subspezies / [[Subspezies]]
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kursiv | Für den Fall, dass unter Subspezies ein Stamm oder Isolat angegeben wird, der nicht kursiv angezeigt werden soll. Wirkt auf die angezeigte Unterart, den Standard für die Bildunterschrift, den angezeigten wissenschaftlichen Namen, und das Artikellemma (wenn es mit letzterem übereinstimmt) | ja (Standardwert) / nein
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Genom | Kurzbeschreibung des Virusgenoms | [[Polarität (Virologie)|(+ / -)ssRNA]] / dsRNA / ssRNA-RT / [[Polarität (Virologie)|(+ / - / +/-)ssDNA]] / dsDNA / dsDNA-RT
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Baltimore | Klassifikation nach Baltimore (keine römischen Zahlen, für gruppenübergreifende Taxa mehrere Angaben/Bereiche ok.) | 4 / 3, 4, 5 / 3 – 5
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Kapsid | Kapsidsymmetrie keine: pleomorph/keine Symmetrie ohne/keines: kapsidlos |
ikosaedrisch / helikal / komplex / keine / ohne / keines / <frei wählbar>
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Virushülle | Virushülle vorhanden oder nicht | vorhanden / keine
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NCBI_Tax | NCBI Taxonomy ID oder Name Für spezielle Fälle (wie HIV) können mehrere Angaben durch Komma oder Strichpunkt getrennt werden, Kurzname optional jeweils hinter ID/Name in Klammern. srchmode: 1=vollst. Name, 2=Wildcards, 3=Token-Set, 4=phonetischer Name, Details siehe NCBI: Linking to the NCBI Taxonomy Database. |
10335 / Cedratvirus&srchmode=3 (alle), 1903266 (A11) / 11676 (HIV-1), 11709 (HIV-2)
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NCBI_Ref | NCBI Reference Genome Mehrere Angaben und optionaler Kurzname wie oben durch Komma trennen, Belege und Anmerkungen am Ende möglich (ref-Tag) |
EU154348.1 / AF033819 (HIV-1), KP890355.1 (HIV-2)
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ViralZone | ViralZone (Expasy, SIB) ID, optional mit Parametern für Zielseite (wird nicht angezeigt) Mehrere Angaben und optionaler Kurzname durch Komma trennen |
220 / 220?outline=all_by_species#tab6 / 7 (HIV-1), 64 (HIV-2)
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ICTV_Tax | ICTV Taxon History Id Mehrere Angaben und optionaler Kurzname durch Komma trennen |
201853121 / 201855030 (HIV-1), 201855031 (HIV-2)
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ICTV | obsolet (veraltet und wird nicht mehr angezeigt) |
Als wissenschaftlicher Name sollte bei ICTV-bestäigten Taxa die offizielle ICTV-Bezeichnung angegeben werden, bei unbestätigten Taxa ersatzweise der NCBI-Name (in doppelten Anführungszeichen). Es erfolgt eine automatische Kursivsetzung, die für Bezeichner unterhalb Art/Spezies („Subspezies“) abgeschaltet werden kann. Dasselbe gilt für die taxonomischen Ränge von Realm bis Spezies (bzw. Subspezies). Lediglich das Feld Name ist derzeit für einen deutschen Namen vorgesehen.
Wenn unbedingt erforderlich, kann die Kursivsetzung für einen einzelnen taxonomischen Rang (Spezies aufwärts) abgescahltet werden mit:
<span style="font-style:normal;">Xyz-Viren</span>
oder (einfacher, aber weniger sicher – die zweifachen Einfach-Anführungszeichen wirken als Umschalter):
''Xyz-Viren''</span>
Hiweise zum Herausfinden der ICTV/NCBI/ViralZone-IDs:
- Wikidata: Taxon suchen – Abschnitt „Identifiers“
- ICTV: ICTV Taxonomy – Suche (Teilstring möglich), ggf. „all ICTV releases“ aktivieren – in der Trefferliste „View“ auf den neuesten passenden Eintrag – in der angezeigten und hervorgehobenen Zeile gant rrechts auf „history“ gehen. Die ID steht in der Adresse der angezeigten Webseite ganz rechts.
- ICTV (nur Spezies): Master Species Lists – die neueste Excel-Liste anzeigen/downloaden - das letzte Datenblatt ist die Liste selbst – dort suchen – die letzte Spalte ganz rechts beinhaltet die Adresse der „history“ (wie oben).
- NCBI (Taxon ID): Taxonomy Browser – Suchen (verschiedene Suchstrategien möglich) – falls Trefferliste angezeigt das gewünschte Taxon auswählen – in der Detailansicht werden die ID, Rang, Synonme etc. angezeigt. Für Spezialzwecke unterstützt die Vorlage neben der Taxon ID auch die anderen Suchstrategien.
- NCBI (Reference): Wenn man in Originalartikeln oder der ICTV-Dokumentation nict fündig wird, findet man Zugriffsnummeren (Accession Numbers) für Genom und/oder Proteom über den NCBI Taxonomy Browser in der Detailansicht (s. o.) – Box rechts – Nucleotide bzw. Protein
- ViralZone: Expasy ViralZone – für die Ränge bis hoch zu Familie führt man die Suche aus (eigene Seiten für Spezies oder darunter gibt es nur in besonders prominenten Fällen). Für die höheren Ränge benutzt man besser die oberen Knöpfe mit den Baltimore-Gruppem (dsDNA, ssDNA usw.), sollte aber keine zu hohen Erwartunegn haben. Interessant auch Viral exotoxin, Modulation of host virulence by virus und Viral latency. Achtung: Manche Seiten haben mehrere Datenblätter, die Vorlage unterstützt das direkte Ansteuern derselben wenn das erste (d. h. linke) leer ist.
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