Marnaviridae

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Marnaviridae
F73-01-9780123846846.png-550x0(R).png

EM-Aufnahme von Partikeln des
Heterosigma akashiwo RNA virus
(HaRNAV). Maßstab 50 nm.

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[1]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Pisuviricota[1]
Klasse: Pisoniviricetes[1]
Ordnung: Picornavirales
Familie: Marnaviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Marnaviridae
Links
NCBI Taxonomy: 324901
ViralZone (Expasy, SIB): 170
ICTV Taxon History: 201901949

Marnaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von positiv-einzelsträngigen RNA-Viren in der Ordnung Picornavirales.[2] Die erste Art (Spezies) dieser Familie, die isoliert wurde (und daher die Typusart der Familie darstellt), ist das Heterosigma akashiwo RNA-Virus (HaRNAV) in der Gattung Marnavirus,[3] das die toxische, blütenbildende Raphidophyten-Alge Heterosigma akashiwo infiziert.[4] Auf Basis von DNA-Sequenzierungen wurden weitere zwanzig marine RNA-Virusspezies in die Familie aufgenommen, verteilt auf sechs Gattungen.[5]

HaRNAV wurde aus dem Wasser in der Straße von Georgia in British Columbia (Kanada) isoliert, aus einer konzentrierten Virusansammlung mit dem Wirt Heterosigma akashiwo (NEPCC 522).[6] HaRNAV darf nicht mit anderen Viren verwechselt werden, die diesen Wirt infizieren, wie z. B. dem dsDNA-Virus Heterosigma akashiwo virus 01 (HaV-1, mit Isolat HaV53) aus der Gattung Raphidovirus oder dem „Heterosigma akashiwo Nuclear Inclusion Virus“ (HaNIV, Vorschlag, ?Gattung Protobacilladnavirus).[7][8][9][10]

Beschreibung

H. akashiwo von der Linie [en] CCMP-452.
Schemazeichnung von H. akashiwo
Genomkarte der Marnaviridae.
Modifiziert nach ViralZone.[11]
Schemazeichnung eines Virions der Familie Marnaviridae, Querschnitt und Seitenansicht.[11]
Chaetoceros tenuissimus RNA virus 01, Gattung Bacillarnavirus: Die MCPs sind in Grün, Magenta und Cyan eingefärbt und das mCP in Gelb..

Die Viren der Marnaviridae sind nicht umhüllt und haben ikosaedrische Geometrie mit einer Triangulationszahl T=pseudo3. Der Durchmesser beträgt etwa 25 nm. Das Genom ist linear und monopartit (nicht segmentiert), mit einer Länge von ca. 8,6 kb (Kilobasen).[11]

Das Kapsid besteht aus drei Hauptkapsidproteinen (

major capsid proteins

, MCPs: VP1, VP2, VP3), die jeweils eine Jelly-Roll-Faltung aufweisen, und einem Minor-Capsid-Protein (

minor capsid proteins

, mCP), das sich auf der Innenseite des Kapsids an den Polen der Fünffach-Achse befindet.[12]

Reproduktionszyklus

Die Replikation folgt dem üblichen Schema für (+)ssRNA-Viren (en.

positive stranded RNA virus replication model

). Die Transkription folgt ebenfalls dem üblichen Schema für (+)ssRNA-Viren (en.

positive stranded RNA virus transcription

). Die neu gebildeten Virionen verlassen die Wirtszelle durch tubulusgeführte Virusbewegung (en.

tubule-guided viral movement

).[11]

Als natürliche Wirte des einzigen gut bekannten Mitglieds HaRNAV der Familie Marnaviridae dient Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). Es wird angenommen, dass auch die anderen Vertreter marines Phytoplankton infizieren.[11]

Systematik

Die Systematik der Marnaviridae ist nach ICTV mit Stand Anfang April 2021 wie folgt:[1]

Ordnung: Picornavirales

  • Familie: Marnaviridae
  • Spezies:
    Chaetoceros socialis forma radians RNA virus 1
     – Wirtsgattung Chaetoceros
  • Spezies:
    Chaetoceros tenuissimus RNA virus 01
     (CtenRNAV) – Wirtsgattung Chaetoceros
  • Spezies:
    Rhizosolenia setigera RNA virus 01
     – Wirtsgattung Rhizosolenia
  • Spezies:
    Astarnavirus
     mit Asterionellopsis glacialis RNA virus – Wirtsgattung Asterionellopsis
  • Spezies:
    Aurantiochytrium single-stranded RNA virus 01
     – Wirtsgattung Aurantiochytrium
  • Spezies:
    Jericarnavirus B
  • Spezies:
    Sanfarnavirus 1
  • Spezies:
    Sanfarnavirus 2
  • Spezies:
    Sanfarnavirus 3
  • Gattung: Marnavirus (eine bestätigte Art, mehrere vorgeschlagene)[13]
  • Spezies:
    Heterosigma akashiwo RNA virus
     (HaRNAV) mit Isolat SOG263[14][15] – Wirtsspezies Heterosigma akashiwo
  • Spezies: „Forsythia suspensa marnavirus“ – Wirtsspezies Hänge-Forsythie
  • Spezies: „Kummerowia striata marnavirus“ – Wirtsgattung Kummerowia
  • Spezies: „Lactuca sativa marnavirus“ – Wirtsgattung Lactuca
  • Spezies: „Lindernia crustacea marnavirus“ – Wirtsgattung Lindernia
  • Spezies: „Trichosanthes kirilowii marnavirus“ – Wirtsspezies Trichosanthes kirilowii
  • Spezies: „Zehneria japonica marnavirus“ – Wirtsgattung Zehneria
  • Spezies:
    Britarnavirus 1
  • Spezies:
    Britarnavirus 4
  • Spezies:
    Palmarnavirus 128
  • Spezies:
    Palmarnavirus 473
  • Spezies:
    Britarnavirus 2
  • Spezies:
    Britarnavirus 3
  • Spezies:
    Chaetarnavirus 2
  • Spezies:
    Chaetenuissarnavirus II
  • Spezies:
    Jericarnavirus A
  • Spezies:
    Palmarnavirus 156

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  2. ↑ Marnaviridae - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses (2011) - International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (Englisch) In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Abgerufen am 27. April 2017.
  3. ↑ Virus Taxonomy: 2014 Release. ICTV. Abgerufen am 15. Juni 2015.
  4. ↑ A. S. Lang, A. I. Culley, C. A. Suttle: Genome sequence and characterization of a virus (HaRNAV) related to picorna-like viruses that infects the marine toxic bloom-forming alga Heterosigma akashiwo. In: Virology. 320, Nr. 2, 2004, S. 206–217. doi:10.1016/j.virol.2003.10.015. PMID 15016544.
  5. ↑ M. Vlok, A. S. Lang, C. A. Suttle: Application of a sequence-based taxonomic classification method to uncultured and unclassified marine single-stranded RNA viruses in the order Picornavirales. In: Virus Evolution. 31;5(2):vez056, 2019. doi:10.1093/ve/vez056. PMID 31908848.
  6. ↑ Vera Tai, Janice E. Lawrence, Andrew S. Lang, Amy M. Chan, Alexander I. Culley, Curtis A. Suttle: Characterization of HaRNAV, a single-stranded RNA virus causing lysis of Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). In: Journal of Phycology. 39, Nr. 2, 28. März 2003, S. 206–217. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.01162.x.
  7. ↑ Janice E. Lawrence, Amy M. Chan, Curtis A. Suttle: A novel virus (HaNIV) causes lysis of the toxic bloom-forming alga Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). In: Journal of Phycology. 37, Nr. 2, 1. Mai 2002, S. 216–222. doi:10.1046/j.1529-8817.2001.037002216.x.
  8. ↑ Y. Bettarel, J. Kan, K. Wang, Kurt E. Williamson, S. Cooney, S. Ribblett, F. Chen, K. Wommack, D. Coats: Isolation and preliminary characterisation of a small nuclear inclusion virus infecting the diatom Chaetoceros cf. gracilis, auf: Semantic Scholar – Biology – Aquatic Microbial Ecology, Corpus ID: 56157535, 2005, doi:10.3354/AME040103. „Chaetoceros nuclear inclusion virus: CspNIV“, „CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus (HaNIV)“
  9. ↑ Keizo Nagasaki: Dinoflagellates, diatoms, and their viruses, in: The Journal of Microbiology 46(3), Juli 2008, S. 235–243, doi:10.1007/s12275-008-0098-y. „CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus (HaNIV)“
  10. ↑ Stephanie Boone: Viruses and Algae, Februar 2004
  11. ↑ a b c d e Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 15. Juni 2015.
  12. ↑ Anna Munke, Kei Kimura, Yuji Tomaru, Kenta Okamoto: Capsid Structure of a Marine Algal Virus of the Order. In: Journal of Virology. 94, Nr. 9, 16. April 2020. doi:10.1128/JVI.01855-19.
  13. ↑ NCBI: Marnavirus (genus)
  14. ↑ NCBI: Heterosigma akashiwo RNA virus SOG263
  15. ↑ UniProt: UniProt: Proteomes - Heterosigma akashiwo RNA virus (strain SOG263)

Weblinks

Abgerufen von „https://de.wikiup.org/index.php?title=Marnaviridae&oldid=225560022“