Pseudomonas-Virus phiCTX

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Pseudomonas-Virus phiCTX
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria[1]
Reich: Heunggongvirae[1]
Phylum: Uroviricota[1]
Klasse: Caudoviricetes[1]
Ordnung: incertae sedis
Familie: Peduoviridae
Unterfamilie: incertae sedis
Gattung: Citexvirus
Art: Citexvirus phiCTX
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Myoviren)
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Pseudomonas virus phiCTX
Links
NCBI Taxonomy: 35343
ViralZone (Expasy, SIB): 3967 (Exotoxin),
3965 (Virulenzfaktor)
ICTV Taxon History: 201900241

Pseudomonas-Virus phiCTX (wissenschaftlich Citexvirus phiCTX, früher Pseudomonas virus phiCTX) ist eine Spezies (Art) von Doppelstrang-DNA-Viren, ehemals Typusspezies der Gattung Citexvirus aus der Familie der Peduoviridae (Klasse Caudoviricetes, Morphotyp Myoviren).[1][2] Als Wirt dienen Bakterien (unter anderem) der Spezies Pseudomonas aeruginosa, was die Viren als Bakteriophagen klassifiziert.[Anm. 1]

Systematik

Die Systematik der Gattung Citexvirus nach

International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)

und NCBI (Stand Anfang April 2022) ist wie folgt:

Klasse: Caudoviricetes, Biovar: Myoviren, Familie: Peduoviridae

  • ohne zugewiesene Unterfamilie
  • Gattung: Citexvirus
  • Spezies: Citexvirus BR319A
  • Spezies: Pseudomonas-Virus Dobby (wiss. Citexvirus dobby, veraltet
    Pseudomonas virus Dobby
    )
  • Stamm: Pseudomonas-Phage Dobby (en.
    Pseudomonas phage Dobby
    , Referenzstamm)
  • Spezies: Pseudomonas-Virus phiCTX (wiss. Citexvirus phiCTX, veraltet
    Pseudomonas virus phiCTX
    , ehem. Typus)
  • Stamm: Pseudomonas-Phage phiCTX (en.
    Pseudomonas phage phiCTX
    , φCTX oder ΦCTX)
  • Spezies: Citexvirus PS75V
  • Spezies: „Pseudomonas-Phage F_HA1961sp/Pa1641“ (en. „
    Pseudomonas phage F_HA1961sp/Pa1641
    “, Vorschlag)
  • Spezies: „Pseudomonas-Phage vB_Pae_BR319a“ (en. „
    Pseudomonas phage vB_Pae_BR319a
    “, Vorschlag)

Beschreibung

Wie alle Myoviren ist auch Pseudomonas-Virus phiCTX unbehüllt und besteht aus einem Kopf (dem eigentlichen Kapsid mit dem genetischen Material) und einem Schwanz, die durch einen Hals getrennt ist.

Die Reproduktion der Virionen (Virusteilchen) beginnt mit dem Anheften an die bakterielle Wirtszelle. Es folgt die Injektion der doppelsträngigen DNA in diese. Die DNA wird danach vom Wirt transkribiert (übersetzt) um neue Partikel herzustellen (Assemblierung). Für die Replikation seines genetischen Inhalts werden DNA-Polymerasen des Wirts benötigt, daher ist der Prozess stark vom Zellzyklus abhängig.[3]

Genom, Proteom, Temperenz und Prophage

Das Genom von Pseudomonas-Virus phiCTX ist unsegmentiert und linear. Das Doppelstrang-DNA-Molekül hat eine Länge von 35.538 bp (Basenpaaren), das 47 offene Leserahmen (englisch

open reading frames

, ORFs) kodiert.[4]

Das Genom von ΦCTX kodiert für ein Exotoxin mit der Bezeichnung Cytotoxin,[5] ein spezielles Zellgift (Zytotoxin), für das im Englischen ebenfalls die Bezeichnung Cytotoxin (im weiteren Sinne) gebräuchlich ist. Akronym für Cytotoxin ist CTX, das kodierende Gen wird mit ctx bezeichnet. Dies darf nicht verwechselt werden mit dem Choleratoxin, für das ebenfalls das Akronym CTX gebräuchlich ist (mit kodierendem Gen ctxAB).[6] Es wird angenommen, dass das Cytotoxin hydrophile Poren in Zellmembranen bildet.[5]

ΦCTX ist ein temperenter Phage, der seine Wirtszelle gewöhnlich nicht durch Lyse abtötet. ΦCTX ist in damit in der Lage, seinem Wirt Pseudomonas aeruginosa durch das ctx-Gen Pathogenität zu verleihen, d. h. ungefährliche Stämme in pathogene (krankmachende) zu verwandelt. Es ist damit ein Virulenzfaktor.[7]

Wirtsspektrum

Als natürliche Wirte der Spezies gelten Bakterien der Spezies Pseudomonas aeruginosa. Intakte Prophagen von Pseudomonas-Phage ΦCTX wurden aber auch im Genom von Vibrionen der Spezies Vibrio coralliilyticus [en], Stamm P1, identifiziert. Es wird daher horizontaler Gentransfer (HGT) zwischen den beiden Gruppen der Gammaproteobacteria angenommen.[8]

Anmerkungen

  1. ↑ Die Spezies ist zu unterscheiden von Vibrio-Virus CTXphi, einer Spezies filamentöser Bakteriophagen der Ordnung Tubulavirales, deren Wirte Vibrionen sind.

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2021.v1, New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37)
  2. ↑ M. J. Adams, E. B. Carstens: Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2012). In: Archives of Virology. 157, Nr. 7, 2012, S. 1411–1422. doi:10.1007/s00705-012-1299-6. PMID 22481600.
  3. ↑ D Baltimore: Expression of animal virus genomes. In: Bacteriological Reviews. 35, Nr. 3, 1971, S. 235–241. PMID 4329869. PMC 378387 (freier Volltext).
  4. ↑ K. Nakayama, S. Kanaya, M. Ohnishi, Y. Terawaki, T. Hayashi: The complete nucleotide sequence of phi CTX, a cytotoxin-converting phage of Pseudomonas aeruginosa: Implications for phage evolution and horizontal gene transfer via bacteriophages. In: Molecular Microbiology. 31, Nr. 2, 1999, S. 399–419. doi:10.1046/j.1365-2958.1999.01158.x. PMID 10027959.
  5. ↑ a b UniProt: UniProtKB - P14608 (CTX_PSEAI), Cytotoxin (ctx) von Pseudomonas aeruginosa
  6. ↑ SIB: Viral exotoxin, auf: ViralZone
  7. ↑ SIB: Modulation of host virulence by virus, auf: ViralZone
  8. ↑ Karen D. Weynberg, Christian R. Voolstra, Matthew J. Neave, Patrick Buerger, Madeleine J. H. van Oppen: From cholera to corals: Viruses as drivers of virulence in a major coral bacterial pathogen, in: Scientific Reports Band 5, Nr. 17889 (2016); doi:10.1038/srep17889, Epub 8. Dezember 2015
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