Catovirus
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„Catovirus“
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„Catovirus“ (CatV, auch CTV) ist eine vorgeschlagene Gattung von Riesenviren im Phylum Nucleocytoviricota (früher
, NCLDV) aus der Familie der Mimiviridae mit nur einer bekannten Spezies, „Catovirus CTV1“.[2][3][4]
Wie alle diese Riesenviren haben sie ein Genom aus einer doppelsträngigen DNA (dsDNA). Die Gattung wurde bei der Analyse von Metagenomproben aus Bodensedimenten von Ablagerungen in der Kläranlage in Klosterneuburg nahe bei Wien, Österreich, gefunden. Zusammen mit „Hokovirus“ wurden dort von Schulz et al. 2017 drei weitere Virusgattungen identifiziert, „Klosneuvirus“, „Hokovirus“ und „Indivirus“, die insgesamt als Klosneuviren (vorgeschlagene Unterfamilie „Klosneuvirinae“) bezeichnet werden.[5]
Die Metagenomanalyse der ribosomalen 18S-rRNA zeigte, dass ihre Wirte einfachen Cercozoa (zumindest) nahestehen.[5]
Genom
„Catovirus“ hat ein großes Genom von 1.532.259 Basenpaaren (bp) und kodiert vorhergesagt 1.427 Proteine bei 1.176 Genfamilien.[6] Dies ist das zweitgrößte Genom unter den genannten Klosneuviren nach „Klosneuvirus“ (1,57 Millionen Basenpaare, 1.272 Genfamilien). Der GC-Gehalt beträgt 26,4 %.[5]
Systematik
Mit Stand April 2020 ist „Catovirus“ noch nicht vom
registriert (
#35).[1] Das
sieht die Gattung „Catovirus“ mit der Spezies „Catovirus CTV1“ in der Familie der Mimiviridae.[2]
Während die Zugehörigkeit aller vier in Klosterneuburg gefundenen Virusgattungen zu den Mimiviridae unbestritten ist, wird die genaue Topologie des Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb dieser Familie derzeit noch diskutiert. Meist werden sie wie bei Schulz et al. (2017) in eine vorgeschlagene Unterfamilie „Klosneuvirinae“ gestellt.[5]
Einige Autoren (CNS 2018) sehen die Klosneuviren inklusive „Bodo-saltans-Virus“ (BsV) in naher Verwandtschaft mit dem Cafeteria-roenbergensis-Virus (CroV) und fassen diese in einer vorläufige Unterfamilie namens „Aquavirinae“.[7] Ein weiterer Vorschlag besteht darin, alle zusammen mit den Mimiviren (mit Mimivirus und „Megavirus“) in eine größere Unterfamilie „Megavirinae“ zu stellen.[8]
Während das NCBI das „Bodo-saltans-Virus“ (BsV) als Spezies in der Gattung „Klosneuvirus“ sieht,[9] schlagen Disa Bäckström et al. (2019), Fig. 3, eine Systematik der Klosneuviren mit dem „Catovirus“ als nächsten Verwandten von BsV unter den vier ursprünglichen Klosneuviren vor.[10] Kladogramme zur inneren Systematik der Klosneuviren finden sich unter Klosneuvirus §Systematik.
Weblinks
- Mitch Leslie: Giant viruses found in Austrian sewage fuel debate over potential fourth domain of life. In: Science, 5. April 2017, doi:10.1126/science.aal1005.
- Fund im Abwasser – Forscher entdecken vier neue Riesenviren. Spiegel Online, 7. April 2017
- Alexandra Zinoviev, Kazushige Kuroha, Tatyana V. Pestova, Christopher U. T. Hellen: Two classes of EF1-family translational GTPases encoded by giant viruses, in: Nucleic Acids Research 47(11), S. 5761–5776, Juni 2019, doi:10.1093/nar/gkz296, PMC 6582330 (freier Volltext), PMID 31216040 (Hirudovirus, Catovirus und Moumouvirus)
- Christoph M. Deeg, Cheryl-Emiliane T. Chow, Curtis A. Suttle: The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea, in: eLife 6. November 2017, doi:10.7554/elife.33014, bioRxiv: 10.1101/214536v1 (Preprint-Volltext)
- Yanze Li, Pascal Hingamp, Hiroyasu Watai, Hisashi Endo, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata: Degenerate PCR Primers to Reveal the Diversity of Giant Viruses in Coastal Waters, in: Viruses 10(9), September 2018, 496, doi:10.3390/v10090496
Einzelnachweise
- ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b Catovirus (Genus). NCBI; abgerufen am 2. August 2019
- ↑ Cativirus CTV1 (Species). NCBI; abgerufen am 20. August 2019
- ↑ Taxonomy – Catovirus (GENUS). Uniprot
- ↑ a b c d Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. 356, Nr. 6333, 7. April 2017, ISSN 0036-8075, S. 82–85. doi:10.1126/science.aal4657.
- ↑ David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators. In: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)
- ↑ List of the main “giant” viruses known as of today. (PDF; 334 kB) Centre national de la recherche scientifique (CNS), Université Aix Marseille, 18. April 2018
- ↑ C.M. Deeg, E.C.T. Chow, C.A. Suttle: The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea. In: eLife. 7, 2018, S. e33014. doi:10.7554/eLife.33014.
- ↑ NCBI: Bodo saltans virus (Spezies), Zugriffsdatum: 2. August 2019
- ↑ Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema; Richard P. Novick (Hrsg.): Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism, in: mBio Vol. 10 Nr. 2 2019, doi:10.1128/mBio.02497-18
