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Ausdrücke mit SARS und CoV, Synonyme und Klammern

Auslagerung nach Baustelle-D.21: Benutzer:Dirk123456/Baustellenbaustelle_001/Baustelle-D/Baustelle-D.21#Ausdrücke_mit_SARS_und_CoV,_Synonyme_und_Klammern.

Vorbereitung 1 - SARS-CoV

SARS-CoV-1 im Artikel SARS-CoV

Hallo, in diesem Diskussionsbeitrag geht es mir (Dirk123456) vor allem um die Darstellung des alternativen Ausdrucks „SARS-CoV-1“.

Ziele:

Im hier zugehörigen Artikel (SARS-CoV):

  • Erwähnung des häufig verwendeten, alternativen Ausdrucks „SARS-CoV-1“ am Anfang der Einleitung und
  • genaue Erläuterung der Herkunft im Abschnitt „Name“.

Nachfolgend in anderen Artikeln:

  • Vermeidung von komplizierten Ausdrücken mit Klammern und von komplizierten Erklärungen
  • durch die Möglichkeit zum Verweis auf den Artikel „SARS-CoV“ (z. B. aus den Artikeln Coronaviridae und SARS-CoV-2).

Hintergrund:

Ein Coronavirus, das „SARS“ verursacht, wurde von der Wissenschaft „SARS-CoV“ genannt. Später wurde ein anderes Coronavirus mit dem Namen „SARS-CoV-2“ belegt. Daraufhin wurde dem „SARS-CoV“ ein zusätzlicher, bisher inoffizieller, aber praktischer Name gegeben: „SARS-CoV-1“.

In der deutschen Wikipedia wurden Klammern verwendet, um beide Namen für ein und dasselbe Virus mit einem Ausdruck anzusprechen. Durch solche Ausdrücke – „SARS CoV[-1]“ und „SARS CoV(-1)“ – entstehen quasi weitere Namen, die woanders nicht oder nur sehr selten und dann in einem speziellen Kontext verwendet werden.

Diese zusätzlichen Ausdrücke bzw. Namen verwirren meiner Ansicht mehr, als dass sie dem besseren Verständnis dienen und daher würde ich (Dirk123456) sie gern vermeiden (und ggf. an geeigneter Stelle erklären).

Klammern innerhalb eines Ausdrucks wurden zwar im Artikel SARS-CoV nicht verwendet, aber in anderen Artikeln: eckige Klammern in SARS-CoV-2 und eckige sowie runde in Coronaviridae.

Im Artikel SARS-CoV ist prinzipell alles Notwendige zu „SARS-CoV-1“ enthalten. Allerdings gibt es eingangs eine Aufzählung von Synonymen, z. B. „früher auch SCV“, wobei „SARS-CoV-1“ in dieser Aufzählung noch nicht auftaucht. Da die Verwendung des neuen Ausdrucks „SARS-CoV-1“ mittlerweise etabliert ist, sollte dieser synonym genutzte Ausdruck vielleicht „mehr nach vorn“ und der Artikel SARS-CoV sollte die „zentrale Anlaufstelle“ zu Fragen um „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-1“ bilden.

Vorarbeiten:

Im November 2020 sind mir die zusätzlichen Klammern aufgefallen und ich habe begonnen, überblicksweise in der deutschen und englischen Wikipedia und viel in PubMed und in den Preprint-Datenbanken bioRxiv und medRxiv zu recherchieren. Es ging mir dabei zuerst um die Frage, ob in der wissenschaftlichen Literatur Klammern verwendet werden – und wenn ja – wie? Könnte es sein, dass SARS-CoV[-1] und/ oder SARS-CoV(-1) eigentlich Ersatz-Dartellungen für SARS-CoV-1 oder etwas Ähnliches sind? Zumindest werden Texte gelegentlich verschieden angezeigt:

  • in einem Suchtreffer bei PubMed z. B. so: „... with a new coronavirus, SARS-CoV-2(1). This outbreak ...“,
  • in der zugehörigen Veröffentlichung aber so: „...with a new coronavirus, SARS-CoV-21. This outbreak ...“ (Shang et al. 2020; PMID 32225175; „Epub 2020 Mar 30“).

Die umklammerte bzw. hochgestellte Ziffer 1 ist in diesem Fall eine Referenz. Meine Suchabfragen bei PubMed ließen die effiziente Einbeziehung von Sonderzeichen nicht zu.

Ich habe dann versucht, den Ursprung der Ausdrücke „SARS-CoV-1“ und „SARS-CoV-2“ zu finden, was aus verschiedenen Gründen schwierig ist.

Letztlich bin ich mir ziemlich sicher, dass die Nutzung des Ausdrucks „SARS-CoV-1“ im Februar 2020 beginnt. Das früheste Beispiel für „SARS-CoV-1“, welches ich gefunden habe, ist eine gleichzeitige Anwendung der Ausdrücke „SARS-CoV-2“ und „SARS-CoV-1“ in einer Publikation von Cordes & Heim (2020; PMID 32143123, doi:10.1016/j.jcv.2020.104305), die am 4. Feb. eingereicht und am 28. Feb. 2020 erstmalig (online) veröffentlicht wurde.

Klammern kommen bei den Ausdrücken „SARS-CoV-2“ und „SARS-CoV-1“ praktisch nur im Kontext einer knappen Erklärung der jeweiligen Abkürzung am Beginn der jeweiligen Publikation vor, z. B. bei „SARS-CoV-2“ zu Jahresbeginn:

  • Haider et al. (2020 Feb 26; PMID 32100667): „Novel Coronavirus (2019-nCoV [SARS-COV-2]) was detected ...“
  • Hellewell et al. (Epub 2020 Feb 28; PMID 32119825): „... controlling a severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-like pathogen. ...“
  • Wang et al. (2020 Feb 24; PMID 32133152): „... due to a novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) happened in Wuhan, Hubei ...“
  • Yang et al. (2020 Feb; PMID 32175421): „... caused by a novel coronavirus [severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)-2], named COVID-19, ....“
  • Stoecklin et al. (2020 Feb; PMID 32070465): „A novel coronavirus (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2) causing ...“
  • Kaul (Epub 2020 Apr 9; PMID 32363221): „... diagnosed novel betacoronavirus or severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)-2 has spread across ...“

Es ist sehr selten, dass versucht wird, den Ausdruck „SARS-CoV-1“ als Alternative zu „SARS-CoV“ darzustellen, indem die zusätzlichen Zeichen separat in Klammern gepackt werden. Ich habe dazu lediglich zwei Beispiele gefundenen. Für beide Zitate gibt es lediglich englische Zusammenfassungen, während die Artikel in Deutsch bzw. in Französische geschrieben sind. Da auch Anführungszeichen im Text vorkommen, gebe ich die Textausschnitte zwischen diesen Zeichen 〈... ...〉 wieder; es folgen die beiden zitierten Artikel und deren Textstellen:

  • Thaler et al. (2020; doi:10.1007/s00347-020-01152-z) vom 18. Juni 2020:
    • Deutsch: 〈... aufgrund der Erfahrungen mit dem „schweres akutes respiratorisches Syndrom-Coronavirus(-1)“ (SARS-CoV(-1)) und ...〉
    • Engl. Zusammenfassung: 〈... due to the experience with severe acute respiratory syndrome -coronavirus(‑1) (SARS-CoV(‑1)) and ...〉
  • Segondy (2020; PMID 33163102) vom 31. Oktober 2020:
    • Französisch:〈... années. Il s’agit du Sars-CoV(-l) apparu en 2003, ...〉
    • Engl. Zusammenfassung: 〈... years. SARS-CoV (-1) appeared in 2003, ...〉

In beiden Fällen wird die Verwendung der Klammern nicht erklärt.

Das erste Beispiel, Thaler et al. (2020; doi:10.1007/s00347-020-01152-z), habe ich in der deutschen Wikipedia im Artikel SARS-CoV-2 gefunden; thematisch geht es in dem Beitrag nicht in erster Linie um die Erforschung von Viren, sondern um praktische Maßnahmen in der Augenheilkunde in Bezug auf das Infektionsrisiko.

Im zweiten Beispiel, Segondy (2020; PMID 33163102), kommen verschiedene Schreibweisen vor. Im französischen Artikel werden außer „Sars-CoV(-l)“ auch die Ausdrücke „Sars-CoV-l“, „Sars-CoV-I“ und „Sars-CoV-1“ verwendet. Die Unterschiede beruhen vermutlich auf Verwechslungen der ähnlich aussehenden Zeichen „l“, „I“ und „1“; in der engl. Zusammenfassung kommt außer „SARS-CoV (-1)“ auch „SARS-CoV-l“ vor. Der Titel Revue francophone des laboratoires (ungefähre Übersetzung: „Französischsprachiger Überblick zu den Laboratorien“) deutet an, dass hier

Am häufigsten wurde eine ausgeschriebene Form für den Ausdruck „SARS-CoV-1“ angegeben, indem diese „Langform“ ohne Klammern in den Text geschrieben wurde und der kurze Ausdruck als Ganzes in Klammern dahinter gesetzt wurde. Dabei konnte die Langform die Ziffer 1 enthalten oder auch nicht.

Langform mit Ziffer 1:

  • Radhakrishnan et al. (Epub 2020 Jun 22; PMID 32719738): „... data from severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), the virus responsible …“
  • Rahman et al. (2020 Jun 5; PMID 32528783): „... by its sister coronaviruses such as severe acute respiratory syndrome coronavirus-1 (SARS-COV-1) and ...“

Langform ohne Ziffer:

  • Lin & Yao (2020 Jun 11; PMID 32606823): „... candidates for severe acute respiratory syndrome (SARS-CoV-1) and provided a brief overview of ...“
  • Pozzer et al. (2020 Dec 1; PMID 33236040): „Analysis of the first severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV-1) outcomes in 2003, and …“

Es gibt auch Veröffentlichungen, in denen eine ausgeschriebene und die Kurzform unterschiedlich eingesetzt werden, z. B.: für „SARS-CoV-2“ beides, für „SARS-CoV-1“ nur die Kurzform und für „MERS-CoV“ nur die Langform:

  • Laine et al. (Epub 2020 May 5; PMID 32369539): „... examined the burden of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), SARS-CoV-1, and Middle East respiratory syndrome coronavirus on health care workers and risk factors for infection.“

SARS-CoV-1 in Nature, Science und Cell

Es liegt auf der Hand, dass auch die Qualität von Veröffentlichung und der zur gegebenen Zeit bestehende Erkenntnisstand eine Rolle spielen. Daher habe ich gezielt in Nature, Science und Cell gesucht. Während ich für einen Suchzeitraum von Anfang Dezember 2019 bis einschließlich November 2020 sehr viele Treffer für Suchmuster mit (sars-cov-2[Title/Abstract]) fand (jeweils mehr als 70 bis knapp 300 Treffer), waren das für für Suchmuster mit (sars-cov-1[Title/Abstract]) nur wenige Treffer: kein Treffer bei Nature, ein Treffer bei Science und zwei Treffer bei Cell:

  • Gordon et al. (2020 Oct 15; PMID 33060197) – RESEARCH ARTICLE in Science: „Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms“,
  • Wei et al. (2020 Oct 20; PMID 33147444) – ARTICLE in Cell: „Genome-wide CRISPR Screens Reveal Host Factors Critical for SARS-CoV-2 Infection“,
  • Wrapp et al. (2020 May 28; PMID 32375025) ARTICLE in Cell: „Structural Basis for Potent Neutralization of Betacoronaviruses by Single-Domain Camelid Antibodies“.

Wrapp et al. vom 28. Mai (2020; PMID 32375025) fällt aus dieser „Qualitäts-Auswahl“ etwas heraus, weil die Arbeit früh im Jahr erschienen ist (es gibt eine Korrektur vom 11. Juni 2020, PMID 32531248, die aufgrund von Verwechselungen recht komplex ist).

In Wei et al. vom 20. Okt. 2020 (PMID 33147444) werden „SARS-CoV-2“ und die resultierende Krankheit „COVID-19“ in der üblichen Weise eingeführt – erklärender Text gefolgt vom jeweiligen kurzen Ausdruck in Klammern:

  • „Identification of host genes essential for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection may reveal novel therapeutic targets and inform our understanding of coronavirus disease 2019 (COVID-19) pathogenesis.“

Gleiches gilt in dieser Arbeit für „MERS-CoV“ und „VSV“, nicht aber für „bat CoV HKU5“ und „SARS-CoV-1“:

  • „... with SARS-CoV-2, Middle East respiratory syndrome CoV (MERS-CoV), bat CoV HKU5 expressing the SARS-CoV-1 spike, and vesicular stomatitis virus (VSV) expressing the SARS-CoV-2 spike.“

In einer vorläufigen Version von Gordon et al., vom 15. Okt. 2020 (PMID 33060197), wurde der umgekehrte Weg beschritten: der kurze Ausdruck, der im Weiteren verwendet werden sollte, wurde ohne Klammern geschrieben und dahinter folgen in Klammern die vollständig geschriebenen, erklärenden Formen für die Teilausdrücke, wobei Bindestriche und Ähnliches dort blieben, wo sie sind:

  • „The COVID-19 (Coronavirus disease-2019) pandemic, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is ...“.

Mittlerweile wurde die alte Version, wie sie unter Pubmed zu finden war, durch eine neue Version, Gordon et al., vom 4. Dezember (2020; PMID 33060197) ersetzt [Science: doi:10.1126/science.abe9403 und PMC 7808408 (freier Volltext)]. In dieser abschließenden Version wird COVID-19 nicht mehr erklärt. Ansonsten wird das herkömmliche Konzept verwendet – erst die Langform, dann die Kurzform in Klammern – z. B.:

  • „... a comparative analysis of the three pathogenic human coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), ...“.

Ich bin relativ sicher, dass innerhalb der drei Journale Nature, Science und Cell die Arbeit von Gordon et al. (vom 4. Dez. 2020; PMID 33060197) gegenwärtig (bis zum 10. Feb. 2021) die jüngste ist, in welcher der Ausdruck SARS-CoV-1 verwendet wird, da ich wiederholt mit entsprechenden Mustern in PubMed danach gesucht habe.

Offizielle Bezeichnungen laut ICTV

Der zuständige Ausschuss, welcher für die Benennung von Viren zuständig ist, das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), listet bisher die Ausdrücke „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-2“, nicht aber den Ausdruck „SARS-CoV-1“. Die letzte Zusammenstellung innerhalb von „Virus Metadata Resource (VMR)“ stammt aus August 2020, basiert auf der Taxonomie-Veröffentlichung 2019, MSL35 (Master Species List #35) und wurde mit aktualisierten Daten zu neuen Arten im März 2020 ratifiziert: „August 1, 2020 release of the Virus Metadata Repository (VMR) file containing updated data on new species ratified in March, 2020 and appearing in taxonomy release 2019, MSL35“ (https://talk.ictvonline.org/taxonomy/vmr/m/vmr-file-repository/10312).

Eine Unterart, ein Stamm oder einfach „ein Virus“?

Das ICTV hat eine Arbeitsgruppe für die Coronaviren, CSG („Coronaviridae Study Group“), welche den Namen „SARS-CoV-2“ veröffentlicht hat (Gorbalenya et al., 2020; Preprint doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z) (Received 05 February 2020 | Accepted 19 February 2020 | Published 02 March 2020 | Issue Date April 2020)

Laut ICTV gehören die Viren, welche mit den Ausdrücken „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-2“ belegt werden, in die Virus-Art Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus. In der letzten Liste vom August 2020 (Master Species List #35“, Datei: „VMR 010820 MSL35.xlsx“, Download unter „https://talk.ictvonline.org/taxonomy/vmr/m/vmr-file-repository/10312“) gibt es vier Einträge zu dieser Art: einen Eintrag, der in der Spalte „Exemplar or additional isolate“ als „E“ gekennzeichnet ist und drei Einträge, die als „A“ gekennzeichnet sind. Den eigentlichen Schlüssel innerhalb der Art scheint die Spalte „Virus isolate designation“ zu bilden. Der Titel „Exemplar virus“ („E“ in Spalte „Exemplar or additional isolate“) wurde dem Stamm „Tor2“ zugesprochen.

  • Der Stamm „Tor2“ (Spalte „Virus isolate designation“)
  • definiert als „Exemplar virus“ („E“, Spalte „Exemplar or additional isolate“)
  • die Art „Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus“ (Spalte „Species“),
  • hat selbst die übliche Bezeichnung „severe acute respiratory syndrome coronavirus“ [Spalte „Virus name(s)“]
  • mit der üblichen Abkürzung „SARS-CoV“ [Spalte „Virus name abbreviation(s)“].

Die Spalten „Virus-Namen“ und „Virus-Abkürzungen“ sollen die gewöhnlich, allgemein, üblicherweise oder häufig genutzten Namen und Abkürzungen enthalten [Legende zu Spalten „Virus name(s)“ und „Virus name abbreviation(s)“: „Commonly used ...“].

Zwei Stämmen, „Tor2“ und „PC4-227“, wird in der Tabelle zwar dieselbe Abkürzung zugesprochen, nämlich „SARS-CoV“; es werden dort aber jeweils verschiedene Namen zugeordnet:

  • dem Stamm „Tor2“ der Virus-Name „severe acute respiratory syndrome coronavirus“ und
  • dem Stamm „PC4-227“ der Virus-Name „SARS coronavirus“.

Das zeigt, dass alles, was an Gruppen-Zuordnungen zwischen der Art-Bezeichnung und der Bezeichnung eines einzelnen Virusstammes stattfindet, eher mehrdeutig ist und schlecht offiziell sein kann. Es gibt auch einen Stamm („BtKY72“), dessen zugeordneter Name sich von der Artbezeichnung (bis auf verschiedene Groß- und Kleinschreibung) nicht unterscheidet. Die beste Unterscheidung von anderen Viren derselben Art bietet der Stamm „Wuhan-Hu-1“, dem der Name „severe acute respiratory syndrome coronavirus 2“ und die Abkürzung „SARS-CoV-2“ zugeordnet wurden.

a
Tabellenausschnitt
A B O P Q R S T U V W
4989 1 Betacoronavirus Merbecovirus Middle East respiratory syndrome-related coronavirus E Middle East respiratory syndrome-related coronavirus MERS-CoV HCoV-EMC JX869059 NC_019843
4995 1 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus E severe acute respiratory syndrome coronavirus SARS-CoV Tor2 AY274119 NC_004718
4995 2 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A severe acute respiratory syndrome-related coronavirus SARSr-CoV BtKY72 KY352407
4995 3 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 MN908947 NC_045512
4995 4 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A SARS coronavirus SARS-CoV PC4-227 AY613950
z

Das Dilemma mit offiziellen und praktikablen Ausdrücken

Die Tatsache, dass die Teilausdrücke /sars/ und /corona/ sowohl bei „SARS“ als auch bei „Corona“ Anwendung finden und die Nummern 1, 2 und 19 aus unterschiedlichen Gründen verschiedenen Dingen zugeordnet wurden, macht eine übersichtliche Erklärung nicht einfach. Ein Kommitee, wie z. B. das ICTV, welches die Regeln für stabile, zuverlässige und eindeutige Benennung festlegen soll, kann den Ereignissen nur verzögert folgen, während die Wissenschaft für die Unterscheidung neuer Sachen auch neue Fachausdrücke (oder zumindest „Arbeitsbegriffe“) braucht.

Mit diesem Dilemma wird unterschiedlich umgegangen. Die häufigst angewendete „Methode“ besteht leider darin, das Problem mit den offiziellen und praktikablen Ausdrücken in wissenschaftlichen Artikeln „zu umschiffen“. So wurden z. B. selbst in einer Arbeit, in der ein Abkürzungsverzeichnis vorhanden ist und in welcher der Ausdruck „SARS-CoV-1“ häufig vorkommt, in dem Verzeichnis zwar die Ausdrücke „SARS“, „SARS-CoV-2“ und „COVID-19“ dargestellt, nicht aber „SARS-CoV“ oder „SARS-CoV-1“ (Zheng et al., 2021 Jan 4; PMID 33397387). Erläuterungen sind in Veröffentlichungen selten; die einzige „Erklärung“ ist meist, dass hinter einem langen Ausdruck die Abkürzung in Klammern steht.

In der Wikipedia haben wir ein ähnliches Dilemma; es sollen nur belegbare Sachen dargestellt werden (WP:BLG) und es soll keine Theoriefindung stattfinden (WP:TF). Insofern ist die Frage, was man mit „SARS-CoV-1“ macht, nicht ganz einfach zu beantworten. Es gibt hinreichend Belege für die Nutzung des Ausdrucks und seiner Varianten.

--

  • Neutralization assay with SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spike pseudotyped murine leukemia virions.
  • Zheng Y, Larragoite ET, Williams ESCP, Lama J, Cisneros I, Delgado JC, Slev P, Rychert J, Innis EA, Coiras M, Rondina MT, Spivak AM, Planelles V. Virol J. 2021 Jan 4;18(1):1. doi: 10.1186/s12985-020-01472-1. PMID 33397387 Free PMC article.
  • Received 15 September 2020 / Accepted 16 December 2020 / Published 04 January 2021. Der Ausdruck SARS-CoV-2 wird in der „Introduction“ ausgeschrieben dargestellt, der Ausdruck SARS-CoV-1 wird nicht erklärt. Es gibt ein Abkürzungsverzeichnis, „Abbrevations“, in welchem zwar „SARS“, „SARS-CoV-2“ und „COVID-19“ ausgeschrieben gezeigt werden, in dem aber weder „SARS-CoV“ noch „SARS-CoV-1“ vorkommen. Interessant ist eine Stelle unter „Results“: „... following membrane viral glycoproteins: SARS-CoV spike (hereafter referred to as SARS-CoV-1), SARS-CoV-2 spike, ...“

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Die Arbeit, Gordon et al. 2020, beschäftigt sich mit einem Vergleich verschiedener, aber verwandter Coronaviren: SARS-CoV-2, SARS-CoV-1 und MERS-CoV. Ein zusammenfassender Begriff mit einem entsprechenden Ausdruck: „SARS/MERS-CoVs“ oder „(SA/ME)RS-CoVs“ wurde nicht erfunden; es gibt aber die den zusammenfassenden Ausdruck „SARS-CoVs“:

  • „... interactions (present in MERS-CoV and absent or lowly confident in both SARS-CoVs), and ...“.

Weiterhin wurden „Arbeitsbegriffe“ verwendet, wie z. B. SARS-MERS, SARS2-SARS1, SARS2-MERS und SARS1-MERS, die im dortigen Kontext erklärt wurden und keine Allgemeingültigkeit besitzen; im Beispiel dienen sie zum Vergleich mehrerer Viren. Für Eigenschaften allgemeiner Natur wurde der Ausdruck „pan-viral“ verwendet. Den Titel:

  • „Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms“

habe ich testweise mit:

Die Formulierung „panvirale Krankheitsmechanismen“ klingt erst einmal, als wenn gemeint wäre, dass durch virale Mechanismen, Pandemien ausgelöst werden können, was gut passen würde; es ist aber wohl eher gemeint, dass Krankheitsmechnismen übergreifend (Vorsilbe pan) bei einer gesamten Gruppe von Viren wirken – pan-viral eben. Jedenfalls legen das andere Wortgruppen mit „pan“ nahe, eine weitere Wortgruppen (neben jener im Titel) mit „pan-viral“ und drei insgesamt mit „pan-coronavirus“:

  • pan-viral : „... exemplary virus-specific and pan-viral interactions.“
  • pan-coronavirus : „Pan-coronavirus interactome ...“ / „... and understand pan-coronavirus molecular mechanisms.“ / „This interaction, however, which is conserved between SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2, could have value as a pan-coronavirus therapeutic target.“

Das Wort „pandemic“ wurde fünfmal verwendet und weitere, relevante Ausdrücke mit der Silbe „pan“ gibt es nicht (irrelevant sind „Expanding“ und „expanded“ und Silben in irrelevanten Teilen des Artikels, z. B. in den Referenzen).

--

Kontrolle in zugeschnittenem Text (untere Teile ab Referenzen entfernt), Suchen und Ersetzen, rot und grün.

Gordon et al. 2020 | https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403.long

pan 12 (rot)

pan-coronavirus 3 (grün)

pan-viral 2 (grün)

pandemic 5 (grün)

Es verbleiben rot: 2

Expanding

expanded

grün = 10 = (3+2+5) = relevant

rot = 2 = irrelevant

alle = 12 = 10 + 2 = Silbe pan (anfangs rot)

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https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403.long

How lethal coronaviruses engage hosts

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is closely related to the deadly coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). ...

Structured Abstract

INTRODUCTION

... a comparative analysis of the three pathogenic human coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), SARS-CoV-2, and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), we identified shared ...

Abstract

The COVID-19 pandemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a grave threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). ...

Fließtext startet mit:

In the past two decades, three deadly human respiratory syndromes associated with coronavirus (CoV) infections have emerged: severe acute respiratory syndrome (SARS) in 2002, Middle East respiratory syndrome (MERS) in 2012, and COVID-19 in 2019. These three diseases are caused by the zoonotic coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), and SARS-CoV-2 (1), respectively. ...

In der Abbildung

Fig. 1 Coronavirus genome annotations and integrative analysis overview.

(A) ... (B to D) ... (E) Overview ... separate study (5). SARS, both SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2; MERS, MERS-CoV; Nsp, nonstructural protein; ORF, open reading frame.

Das Letzte ist die Legende der gesamten Abbildung: "SARS, both SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2; MERS, MERS-CoV; Nsp, nonstructural protein; ORF, open reading frame."

Mit SARS und MERS sind nicht die Krankheiten gemeint, sondern die Teilausdrücke Am Beginn von Zeichenketten. Nsp meint z. B. Nsp16 und ORF meint z. B. ORF1b.

So wollte man es wohl nicht machen: "SARS, severe acute respiratory syndrome; MERS, Middle East respiratory syndrome; CoV, coronavirus; ..."

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Am 3. Dezember 2020, 21:00 Uhr MEZ, war unter PubMed die Vorversion Gordon et al. vom 15. Okt. 2020 (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33060197/) zu sehen und der Link zur Seite von Science verwies auf Gordon et al. vom 4. Dezember 2020 (https://doi.org/10.1126/science.abe9403; → https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403)

-- Verschiedene Orte und Zeiten und Versionen von Gordon et al. 2020 --

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33060197/

Science. 2020 Oct 15;eabe9403. doi: 10.1126/science.abe9403. Online ahead of print.

Abstract

The COVID-19 (Coronavirus disease-2019) pandemic, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is a significant threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and MERS-CoV. Here, we have carried out comparative viral-human protein-protein interaction and viral protein localization analysis for all three viruses. Subsequent functional genetic screening identified host factors that functionally impinge on coronavirus proliferation, including Tom70, a mitochondrial chaperone protein that interacts with both SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 Orf9b, an interaction we structurally characterized using cryo-EM. Combining genetically-validated host factors with both COVID-19 patient genetic data and medical billing records identified important molecular mechanisms and potential drug treatments that merit further molecular and clinical study.

Copyright © 2020 The Authors, some rights reserved; exclusive licensee American Association for the Advancement of Science. No claim to original U.S. Government Works. Distributed under a Creative Commons Attribution License 4.0 (CC BY).

https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403.long

RESEARCH ARTICLE

Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms

View ORCID ProfileDavid E. Gordon1,2,3,4,*, View ORCID ProfileJoseph Hiatt1,4,5,6,7,*, View ORCID ProfileMehdi Bouhaddou1,2,3,4,*, View ORCID ProfileVeronica V. Rezelj8,*, View ORCID ProfileSvenja Ulferts9,*, View ORCID ProfileHannes Braberg1,2,3,4,*, ... ... Oren S. Rosenberg1,2,12,36,37,41,§, Kliment A. Verba1,2,12,14,§, Christopher F. Basler10,§, Marco Vignuzzi8,§, Andrew A. Peden20,§, Pedro Beltrao16,§, Nevan J. Krogan1,2,3,4,21,§

See all authors and affiliations

Science  04 Dec 2020:

Vol. 370, Issue 6521, eabe9403

DOI: 10.1126/science.abe9403

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How lethal coronaviruses engage hosts

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is closely related to the deadly coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). Considerable efforts are focused on developing treatments, and therapies that work across coronaviruses would be particularly valuable. Shedding light on the host factors hijacked by the viruses, Gordon et al. mapped the interactions between viral and human proteins for SARS-CoV-2, SARS-CoV-1, and MERS-CoV; analyzed the localization of viral proteins in human cells; and used genetic screening to identify host factors that either enhance or inhibit viral infection. For a subset of the interactions essential for the virus life cycle, the authors determined the cryo–electron microscopy structures and mined patient data to understand how targeting host factors may be relevant to clinical outcomes.

Science, this issue p. eabe9403 {Link: https://science.sciencemag.org/lookup/doi/10.1126/science.abe9403}

Structured Abstract

INTRODUCTION

The emergence of three lethal coronaviruses in <20 years and the urgency of the COVID-19 pandemic have prompted efforts to develop new therapeutic strategies, including by repurposing existing agents. After performing a comparative analysis of the three pathogenic human coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), SARS-CoV-2, and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), we identified shared biology and host-directed drug targets to prioritize therapeutics with potential for rapid deployment against current and future coronavirus outbreaks.

RATIONALE

...

RESULTS

...

CONCLUSION

...

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Abstract

The COVID-19 pandemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a grave threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). Here, we have carried out comparative viral-human protein-protein interaction and viral protein localization analyses for all three viruses. Subsequent functional genetic screening identified host factors that functionally impinge on coronavirus proliferation, including Tom70, a mitochondrial chaperone protein that interacts with both SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 ORF9b, an interaction we structurally characterized using cryo–electron microscopy. Combining genetically validated host factors with both COVID-19 patient genetic data and medical billing records identified molecular mechanisms and potential drug treatments that merit further molecular and clinical study.

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In the past two decades, three deadly human respiratory syndromes associated with coronavirus (CoV) infections have emerged: severe acute respiratory syndrome (SARS) in 2002, Middle East respiratory syndrome (MERS) in 2012, and COVID-19 in 2019. These three diseases are caused by the zoonotic coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), and SARS-CoV-2 (1), respectively. Before their emergence, human coronaviruses were associated with usually mild respiratory illness. To date, SARS-CoV-2 has sickened millions and killed more than 1 million people worldwide. This unprecedented challenge has prompted widespread efforts to develop vaccine and antiviral strategies, including repurposed therapeutics, which offer the potential for treatments with known safety profiles and short development timelines. The successful repurposing of the antiviral nucleoside analog Remdesivir (2) as well as the host-directed anti-inflammatory steroid dexamethasone (3) provide clear proof that existing compounds can be crucial tools in the fight against COVID-19. Despite these promising examples, there is still no curative treatment for COVID-19. Additionally, as with any virus, the search for effective antiviral strategies could be complicated over time by the continued evolution of SARS-CoV-2 and possible resulting drug resistance (4).

...

Gegen Ende der Website kommt:

... provided the original work is properly cited. To view a copy of this license, visit https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/. This license does not apply to figures/photos/artwork or other content included in the article that is credited to a third party; obtain authorization from the rights holder before using such material.

View Abstract --> https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403.abstract

Dort finden sich die die drei grauen Kästen: „How lethal coronaviruses engage hosts“, „Structured Abstract“ und „Abstract“. Im „Structured Abstract“ gibt es die Unter-Überschriften „INTRODUCTION“, „RATIONALE“, „RESULTS“ und „CONCLUSION“ (mit der Abbildung „Overview of the approaches taken for systemic and functional comparison of pathogenic human coronaviruses.“). Dann geht es ohne den eigentlichen Artikel zu:

https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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View Full Text --> und wieder zurück: https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403.full

https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403/tab-pdf

Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms David E. Gordon*, Joseph Hiatt*, Mehdi Bouhaddou*, Veronica V. Rezelj*, Svenja Ulferts*, Hannes Braberg*, Alexander S. Jureka*, Kirsten Obernier*, Jeffrey Z. Guo*, Jyoti Batra*, Robyn M. Kaake*, Andrew R. Weckstein*, Tristan W. Owens*, Meghna Gupta*, Sergei Pourmal*, Erron W. Titus*, Merve Cakir* et al.

INTRODUCTION: The emergence of three lethal coronaviruses in <20 years and the urgency of the COVID-19 pandemic have prompted efforts to develop new therapeutic strategies, including by repurposing existing agents. After performing a comparative analysis of the three pathogenic human coronaviruses severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARSCoV-1), SARS-CoV-2, and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), we identified shared biology and host-directed drug targets to prioritize therapeutics with potential for rapid deployment against current and future coronavirus outbreaks.

https://science.sciencemag.org/content/370/6521/eabe9403/tab-article-info

Article Information

vol. 370 no. 6521

DOI:

https://doi.org/10.1126/science.abe9403

PubMed: 33060197

Published By: American Association for the Advancement of Science

Print ISSN: 0036-8075

Online ISSN: 1095-9203

History:

  • Received for publication September 24, 2020
  • Accepted for publication October 12, 2020

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Copyright © 2020 The Authors, some rights reserved; exclusive licensee American Association for the Advancement of Science. No claim to original U.S. Government Workshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution license, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.

Ausdruck "SARS-CoVs"

--> zwei Varianten: „CoVs“ – Zitat des RKI (Größe des Virus), siehe auf der Diskussionsseite: PMID 32770582 – Kaniyala Melanthota, S., Banik, S., Chakraborty, I., Pallen, S., Gopal, D., Chakrabarti, S., and Mazumder, N. (2020). Elucidating the microscopic and computational techniques to study the structure and pathology of SARS-CoVs. Microsc Res Tech.

Umsetzungsexperimente
Für Artikel SARS-CoV-2:

Hufeisennasen – möglicherweise mehrere höhlen­bewohnende Arten – waren das Reservoir des Erregers SARS-CoV[-1], der die SARS-Epidemie einige Jahre zuvor ausgelöst hatte, mit dem Larvenroller (Paguma larvata) als möglichem Zwischen­wirt zwischen Fleder­tier und Mensch.

[30.] - /[1]/ - Alexandre Hassanin: Coronavirus Could Be a ‘Chimera’ of Two Different Viruses, Genome Analysis Suggests, auf: sciencealert vom 24. März 2020 (Quelle: The Conversation)

Eine Rekombination von Segmenten als Ganzes (Reassortment) ist also im Gegensatz zu diesen nicht möglich. Insbesondere um den Ursprung des alten SARS-Virus SARS-CoV[-1] zu erklären wurde bereits früher bei dieser Virusfamilie einen Rekombinationsmechanismus, und zwar innerhalb des (einzigen) Genom-Segments, beschrieben (homologe Rekombination).

[30.] - Alexandre Hassanin: Coronavirus Could Be a ‘Chimera’ of Two Different Viruses, Genome Analysis Suggests, auf: sciencealert vom 24. März 2020 (Quelle: The Conversation)

[113.] - /[2]/ - Rachel L. Graham, Ralph S. Baric: Recombination, Reservoirs, and the Modular Spike: Mechanisms of Coronavirus Cross-Species Transmission, in: ASM: Journal of Virology 84 (7), März 2010, S. 3134-3146, doi:10.1128/JVI.01394-09, PDF

Chinesische Forscher berichteten im April 2020 in der Fachzeitschrift Science, dass sich das Virus in Hunden, Schweinen, Hühnern und Enten nur schlecht („poorly“) vermehre, und bestätigten, dass Frettchen und Katzen infiziert werden können. Auch Goldhamster, die nach einer Infektion mit SARS-CoV[-1] nur sehr schwache Symptome entwickelt hatten und daher als Modelltiere ungeeignet waren, ließen sich im Labor mit SARS-CoV-2 infizieren, zeigten deutliche Symptome und wiesen hohe Viruskonzentrationen in Lunge und Darm auf.

[175.] - /[3]/ - Jon Cohen: From mice to monkeys, animals studied for coronavirus answers. In: Science, Band 368, Nr. 6488, 2020, S. 221 f, doi:10.1126/science.368.6488.221, Volltext

Auch der Verdauungstrakt war betroffen, so wie es bei manchen menschlichen Patienten beobachtet wird. Sie scheinen damit geeignet, um etwa einen Impfstoff zu testen, bevor er Menschen verabreicht wird;[4][5] eine Alternative zur Methode die Wirkung eines Mittels auf künstlich mutierte Sarbecoviren zu testen, wie jüngst bei Remdesivir und SARS-CoV/SARS-CoV-2 RdRp (altes SARS-Virus mit RdRP-Gen von SARS-CoV-2) geschehen.[6][7]

[174.] - Shi-Hui Sun, You-Chun Wang et al.: A Mouse Model of SARS-CoV-2 Infection and Pathogenesis, in: Cell Host and Microbe vom 26. Mai 2020, doi:10.1016/j.chom.2020.05.020

[175.] - Jacinta Bowler: Scientists Find a Way to Infect Mice With Coronavirus. Here's Why That's So Important, auf: sciencealertvom 1. Juni 2020

[176.] - Andrea J. Pruijssers et al.: Remdesivir inhibits SARS-CoV-2 in human lung cells and chimeric SARS-CoV expressing the SARS-CoV-2 RNA polymerase in mice, in: Cell Reports vom 7. Juli 2020, doi:10.1016/j.celrep.2020.107940 (freies Pre-Proof)

[177.] - Tina Hesman Saey: Remdesivir may work even better against COVID-19 than we thought, auf: ScienceNews vom 13. Juli 2020

Für Artikel SARS-CoV-2:

Text der Anm.

„SARS-CoV“ und „SARS-CoV-1“ sind Synonyme: Im Jahr 2002 ist ein Coronavirus als Auslöser einer Erkrankung, ein schweres akutes Atemwegssyndrom beim Menschen, in Erscheinung getreten. Die Erkrankung benannte man mit „SARS“ (von engl. severe acute respiratory syndrome – dtsch. „schweres akutes Atemwegssyndrom“) und das verursachende Virus benannte man mit „SARS-CoV“ (Zusammensetzung aus SARS und coronavirus). Im Jahr 2019 trat ein anderes Coronavirus als Auslöser eines schweren akuten Atemwegssyndroms beim Menschen in Erscheinung. Die Erkrankung, die „SARS“ ähnelt, benannte man letztlich mit „COVID-19“ (Zusammensetzung aus coronavirus disease und dem Jahr 2019) und das Virus, dass „SARS-CoV“ ähnelt, letztlich mit „SARS-CoV-2“ (vorher z. B. 2019-nCoV). Etwa ab Februar 2020 setzte sich ein neuer Ausdruck für „SARS-CoV“ durch, nämlich „SARS-CoV-1“. Ein Beispiel für eine frühe, gleichzeitige Anwendung der Ausdrücke „SARS-CoV-2“ und „SARS-CoV-1“ ist eine Publikation von Cordes & Heim (2020; PMID 32143123, doi:10.1016/j.jcv.2020.104305), die am 4. Feb. eingereicht und am 28. Feb. 2020 erstmalig (online) veröffentlicht wurde.

oder

Die Ausdrücke „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-1“ sind Synonyme; siehe Artikel SARS-CoV.

Die Ausdrücke „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-1“ werden als Synonyme genutzt (siehe Artikel SARS-CoV).

Für Artikel SARS-CoV:
  • Der Ausdruck SARS-CoV-1 fehlt in der jetzigen Aufzählung der Namen und wird ergänzt: "seit Feb. 2020 auch SARS-CoV-1", weil er zunehmend wichtiger geworden ist; die Herkunft wird über eine Anmerkung zum Abschnitt „Name“ verlinkt.
  • Ein Zitat, Andersen et al. 2020 ("The proximal origin of SARS-CoV-2"), trifft nicht den Satz seiner jetzigen Anwendung zu: "Zur Unterscheidung ... als SARS-CoV-1 bezeichnet.", sondern auf den vorausgehenden Satz; das Zitat wird dorthin verschoben.
  • Der Satz ("Zur Unterscheidung ... als SARS-CoV-1 bezeichnet.") wird an seiner bisherigen Stelle entbehrlich, da sein Inhalt an anderer Stelle dargestellt wird.

alt, Einleitung

SARS-CoV (englisch

severe acute respiratory syndrome coronavirus

, SARS-Coronavirus,[8] früher auch SCV[9]) bezeichnet den Verursacher des schweren akuten Atemwegssyndroms (SARS). Das Virus gehört zur Spezies Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (

SARS-assoziiertes Coronavirus

, SARSr-CoV) in der Untergattung Sarbecovirus in der Gattung Betacoronavirus.[10] Ein weiteres Virus dieser Virenspezies, SARS-CoV-2, ist Auslöser der COVID-19-Pandemie von 2019/2020.[11][12] Zur Unterscheidung wird das ursprüngliche Virus der Pandemie 2002/2003 (Gegenstand dieses Artikels) gelegentlich auch als SARS-CoV-1 bezeichnet.[13]

alt, Überschrift „Name“


Für die Schreibweise „SARS-CoV-1“ gibt es diese Probleme nicht. Der Name verweist immer auf das Virus (bzw. die Subspezies), nicht auf die Spezies.

neu, Einleitung

SARS-CoV (englisch

severe acute respiratory syndrome coronavirus

, SARS-Coronavirus,[14] früher auch SCV,[15] seit Feb. 2020 auch SARS-CoV-1) bezeichnet den Verursacher des schweren akuten Atemwegssyndroms (SARS). Das Virus gehört zur Spezies Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (

SARS-assoziiertes Coronavirus

, SARSr-CoV) in der Untergattung Sarbecovirus in der Gattung Betacoronavirus.[16] Ein weiteres Virus dieser Virenspezies, SARS-CoV-2, ist Auslöser der COVID-19-Pandemie von 2019/2020.[17][18]

neu, Überschrift „Name“

Für die Schreibweise „SARS-CoV-1“ gibt es diese Probleme nicht. Der Name verweist immer auf das Virus (bzw. die Subspezies), nicht auf die Spezies. Der Ausdruck „SARS-CoV-1“ wurde einführt und zunehmend verwendet, als ein eng verwandtes Coronavirus, das ebenfalls ein schweres akutes Atemwegssyndrom – die Krankheit COVID-19 – beim Menschen verursachen kann, als „SARS-CoV-2“ bezeichnet wurde. Etwa ab Februar 2020 setzte sich der neuer Ausdruck „SARS-CoV-1“ anstelle von „SARS-CoV“ durch. Ein Beispiel für eine frühe, gleichzeitige Anwendung der Ausdrücke „SARS-CoV-2“ und „SARS-CoV-1“ ist eine Publikation von Cordes & Heim,[19] die am 4. Feb. eingereicht und am 28. Feb. 2020 erstmalig (online) veröffentlicht wurde. Zur Unterscheidung wird das ursprüngliche Virus der Pandemie 2002/2003 (Gegenstand dieses Artikels) gelegentlich auch als SARS-CoV-1 bezeichnet.[20]

Text der Anm.

oder

„SARS-CoV“ und „SARS-CoV-1“ sind Synonyme: Im Jahr 2002 ist ein Coronavirus als Auslöser einer Erkrankung, ein schweres akutes Atemwegssyndrom beim Menschen, in Erscheinung getreten. Die Erkrankung benannte man mit „SARS“ (von engl. severe acute respiratory syndrome – dtsch. „schweres akutes Atemwegssyndrom“) und das verursachende Virus benannte man mit „SARS-CoV“ (Zusammensetzung aus SARS und coronavirus). Im Jahr 2019 trat ein anderes, Coronavirus als Auslöser eines schweren akuten Atemwegssyndroms beim Menschen in Erscheinung. Die Erkrankung, die „SARS“ ähnelt, benannte man letztlich mit „COVID-19“ (Zusammensetzung aus coronavirus disease und dem Jahr 2019) und das Virus, dass „SARS-CoV“ ähnelt, letztlich mit „SARS-CoV-2“ (vorher z. B. 2019-nCoV). Etwa ab Februar 2020 setzte sich ein neuer Ausdruck für „SARS-CoV“ durch, nämlich „SARS-CoV-1“. Ein Beispiel für eine frühe, gleichzeitige Anwendung der Ausdrücke „SARS-CoV-2“ und „SARS-CoV-1“ ist eine Publikation von Cordes & Heim (2020; PMID 32143123, doi:10.1016/j.jcv.2020.104305), die am 4. Feb. eingereicht und am 28. Feb. 2020 erstmalig (online) veröffentlicht wurde.

Für Artikel Coronaviridae

alt:

Es gibt hinsichtlich der Ausdrücke "SARS-CoV" und "SARS-CoV-1" zusätzliche "Anhängsel": "[-1]" und " [1]" sowie eine "Anmerkung: ".

Da die Anmerkung unterhalb einer Aufzählung im Fließtext steht könnte man denken, "[1]" bezöge sich darauf. Die gesamte Konstruktion hat viel runde, wie auch eckige Klammern, von denen einige im wahrsten Sinne des Wortes ausgeklammert werden können.

SARS-CoV[-1] (severe acute respiratory syndrome coronavirus [1])

Unter den menschlichen Coronaviren besonders bekannt geworden sind die folgenden Coronaviren:

  • SARS-CoV[-1] (severe acute respiratory syndrome coronavirus [1])
  • MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus)
  • SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)

Sie waren bzw. sind die Auslöser der SARS-Pandemie 2002/2003, der MERS-Epidemie (ab 2012) und der COVID-19-Pandemie (ab 2019).

Anmerkung: Zur klareren und sinnvolleren Unterscheidung zwischen den Coronaviren SARS-CoV und SARS-CoV-2 wird SARS-CoV gelegentlich auch als SARS-CoV-1 bezeichnet.

alt 2 :

Eine ursächliche Beteiligung an Gastroenteritiden ist möglich, spielt jedoch klinisch und zahlenmäßig keine große Rolle.[21] Insgesamt sind sieben humanpathogene Coronaviren bekannt (Stand Februar 2020): neben SARS-CoV(-1), SARS-CoV-2 und MERS-CoV noch HCoV-HKU1, HCoV-OC43 (alle zur Gattung Betacoronavirus), HCoV-NL63 und HCoV-229E (beide zur Gattung Alphacoronavirus).

neu:

Unter den menschlichen Coronaviren besonders bekannt geworden sind die folgenden Coronaviren:

  • SARS-CoV (severe acute respiratory syndrome coronavirus) bzw. SARS-CoV-1,[A 1]
  • MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus),
  • SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2).

Sie waren bzw. sind die Auslöser der SARS-Pandemie 2002/2003, der MERS-Epidemie (ab 2012) und der COVID-19-Pandemie (ab 2019).

neu 2 :

Eine ursächliche Beteiligung an Gastroenteritiden ist möglich, spielt jedoch klinisch und zahlenmäßig keine große Rolle.[22] Insgesamt sind sieben humanpathogene Coronaviren bekannt (Stand Februar 2020): neben SARS-CoV,[A 1] SARS-CoV-2 und MERS-CoV noch HCoV-HKU1, HCoV-OC43 (alle zur Gattung Betacoronavirus), HCoV-NL63 und HCoV-229E (beide zur Gattung Alphacoronavirus).

Materialsammlung

Ausdruck "subspecies" u. Ä.

Untersuchung der vier Zitate in den Taxoboxen von

In den beiden WP:Taxoboxen der Artikel „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-2“ gibt es gegenwärtig (3.3.'21) eine Zeile (bzw. Rubrik) „Unterart“ für die ingesamt vier Zitate angegeben werden. Die ungefähre gegenwärtige Normalansicht habe ich in der folgenden Tabelle nachgestellt:

Zeile „Unterart“ in den Taxoboxen
Artikel „SARS-CoV“ | z. Z. (3.3.'21) oldid=209300463 vom 28.2.'21 | Titel der Taxobox: „SARS-Coronavirus“ | Zeile „Unterart“:
Unterart: severe acute respiratory syndrome coronavirus[3][4][5]

Zitate in der Taxobox – Nr. „3.“: Lau et al. (2005; PMID 16169905); Nr. „4.“: Hu et al. (2017; PMID 29190287); Nr. „5.“: Drexler et al. (2014; PMID 24184128)

Artikel „SARS-CoV-2“ | z. Z. (3.3.'21) oldid=209346396 vom 1.3.'21 | Titel der Taxobox: „SARS-CoV-2“ | Zeile „Unterart“:
Unterart: severe acute respiratory syndrome coronavirus 2[3]

Zitat in der Taxobox – Nr. „3.“: Gorbalenya et al. (2020; PMID 32123347; CSG – Coronaviridae Study Group of the ICTV)

Ich habe die Texte der vier Zitate nach verschiedenen Zeichenketten durchsucht, vor allem nach „subspecies“. Keines der vier Zitate, die in den Wikipedia-Artikeln „SARS-CoV“ und „SARS-CoV-2“ in den Taxoboxen in den Zeilen „Unterart:“ angewendet wurden, enthält – bezogen auf die Coronaviren – den entsprechenden englischen Schriftzug „subspecies“; der Begriff der Unterart bzw. „subspecies“ lässt sich nur bezogen auf Wirtstiere finden. Unterhalb des offiziellen taxonomischen Ranges „Species“ (bzw. unterhalb der Virusart) wendet das „Internationale Commitee für die Taxonomie der Viren“ (ICTV, International Committee on Taxonomy of Viruses) keine taxonomischen Ränge an. Um dennoch phylogenetische Studien usw. betreiben zu können, werden andere Begriffe bemüht, z. B. Gruppe („group“), Klade („clade“) und Cluster.

Die Veröffentlichung, die sich mit der Frage beschäftigt, wie der Ausdruck und „SARS-CoV-2“ gegenüber anderen Ausdrücken, z. B. „SARS-CoV“ eingeordnet werden soll, kommt von der CSG, der „Coronaviridae Study Group of the ICTV“, Gorbalenya et al. (2020, 2. März; PMID 32123347). Es wird von „Schwesterkladen" gesprochen (im „Abstract“):

  • „... Based on phylogeny, taxonomy and established practice, the CSG recognizes this virus as forming a sister clade to the prototype human and bat severe acute respiratory syndrome coronaviruses (SARS-CoVs) of the species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, and designates it as SARS-CoV-2. ...“
  • Ungefähre Übersetzung: „... Basierend auf Phylogenie, Taxonomie und etablierter Praxis erkennt das CSG, dass dieses Virus [zuvor „2019-nCoV“ genannt] eine Schwesterklade in Bezug zu den Prototypen von Coronaviren mit schwerem akutem respiratorischem Syndrom (SARS-CoVs) beim Menschen und bei Fledertieren bildet, wobei die genannten Kladen zur Spezies Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus gehören, und bezeichnet es [das Virus] als SARS-CoV-2. ...“

+ Gorbalenya et al. (2020; PMID 32123347) / SARS-CoV-2 | ref 3. / am 2. März 2020 im Namen von CSG: „Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses“ / „The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2“. Nat Microbiol 5, 536–544 (2020). https://doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z / PMID 32123347 / PMC7095448 / { Alexander E. Gorbalenya, Susan C. Baker, Ralph S. Baric, Raoul J. de Groot, Christian Drosten, Anastasia A. Gulyaeva, Bart L. Haagmans, Chris Lauber, Andrey M Leontovich, Benjamin W. Neuman, Dmitry Penzar, Stanley Perlman, Leo L.M. Poon, Dmitry Samborskiy, Igor A. Sidorov, Isabel Sola, John Ziebuhr: . In: . 11. Februar 2020, bioRxiv: 10.1101/2020.02.07.937862v1 (Preprint-Volltext), S. 1–20, doi:10.1101/2020.02.07.937862 (englisch).}

  • «subspecies»: 0 / «group»: Sehr häufig / «sub»: Abschnitt 《Defining the place of SARS-CoV-2 within the Coronaviridae》 „Previously, the CSG established that each of these two viruses prototype a new species in a new informal subgroup of the genus Betacoronavirus{15,16}. These two informal subgroups were recently recognized as subgenera Sarbecovirus and Merbecovirus{18,28,29} when the subgenus rank was established in the virus taxonomy{30}.“ / Abschnitt 《Classifying and naming viruses and virus species》„The Study Groups are responsible for assigning viruses to virus species and taxa of higher ranks, such as subgenera, genera and subfamilies.“ / «clade» «sister clade»: 《(Abstract)》„Based on phylogeny, taxonomy and established practice, the CSG recognizes this virus as forming a sister clade to the prototype human and bat severe acute respiratory syndrome coronaviruses (SARS-CoVs) of the species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, and designates it as SARS-CoV-2.“ / Abschnitt《Classifying and naming viruses and virus species》„... monophyletic groups of viruses, often known as genotypes or clades, which may or may not include viruses of different hosts.“

+ Lau et al. (2005; PMID 16169905) / SARS-CoV | ref 3. / Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo, Kenneth S. M. Li, Yi Huang, Hoi-Wah Tsoi, Beatrice H. L. Wong, Samson S. Y. Wong, Suet-Yi Leung, Kwok-Hung Chan, and Kwok-Yung Yuen: . In: 27. September 2005, Erster Satz, doi:10.1073/pnas.0506735102, PMID 16169905, PMC 1236580 (freier Volltext) – (englisch): “severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)”

  • «subspecies»: eigentlich 0; nur im Zusammenhang mit Feldermaus《Discussion》„R. sinicus was previously called R. rouxii subspecies sinicus, but recent karyotyping study has elevated its status to a separate species (35).“ / «species», zumeist als «interspecies transmission»: häufig verwendet, bezieht sich aber nur auf Wirte (Menschen, Fledermäuse und Schleichkatzen). / «cluster», in «distinct cluster»: 《ABSTRACT》„Phylogenetic analysis showed that bat-SARS-CoV formed a distinct cluster with SARS-CoV as group 2b CoV, distantly related to known group 2 CoV.“ / «group» sehr häufig - group 1 CoV (bat-CoV-HKU2); group 1 (HCoV-229E and HCoV-NL63); group 2 (HCoV-OC43 and CoV-HKU1); group 2 and 3 CoV; group 2b CoV (25, 26); ... /

+ Hu et al. (2017; PMID 29190287) / SARS-CoV | ref 4. / Ben Hu, Lei-Ping Zeng, Xing-Lou Yang, Xing-Yi Ge, Wei Zhang, Bei Li, Jia-Zheng Xie, Xu-Rui Shen, Yun-Zhi Zhang, Ning Wang, Dong-Sheng Luo, Xiao-Shuang Zheng, Mei-Niang Wang, Peter Daszak, Lin-Fa Wang, Jie Cui, Zheng-Li Shi: . In: Christian Drosten (Hrsg.): . 30. November 2017, Zweiter Satz, doi:10.1371/journal.ppat.1006698 (englisch): “SARS coronavirus (SARS-CoV)” / PMC5708621 /

  • «subspecies»: 0 («sub»: als «subunit» von S-Proteinen, als «subpopulation» von Fledermäusen) / «species»: im Prinzip 0; nur als Fledermaus-Arten 《Abstract》 „... multiple species of horseshoe bats in Yunnan ...“ / «group»: 《Author summary》 „Herein, we report the identification of a diverse group of bat SARSr-CoVs in a single cave in Yunnan, China.“, 《Introduction》 „... group 2b CoV and is now a member of the lineage B of genus Betacoronavirus in the family Coronaviridae [4].“ / «clade» „... the SARSr-CoV S gene, ... receptor-binding domain (RBD) of SARS-CoV, were ... could be divided into two large clades, both of which included multiple genotypes. Clade 1 strains shared ..., while clade 2 ...“ / «rank»: 0; «systematic»: 《Introduction》„Here we report the latest results of our 5-year longitudinal surveillance of bat SARSr-CoVs in this single location and systematic evolutionary analysis using full-length genome sequences of 15 SARSr-CoV strains (11 novel ones and 4 from previous studies).“

+ Drexler et al. (2014; PMID 24184128) / SARS-CoV | ref 5. / Jan Felix Drexler, Victor Max Corman, Christian Drosten: . In: . Volume, Nr. 101, Januar 2014, S. 45–56, Zweiter Satz im Abstract, doi:10.1016/j.antiviral.2013.10.013 (englisch): “This virus, termed severe acute respiratory syndrome-CoV”

  • «subspecies»: 0; / «subfamily»: 《Coronavirus genomic organization》„CoVs belong to the order Nidovirales, family Coronaviridae and subfamily Coronavirinae, comprising four genera termed Alpha-, Beta-, Gamma- and Deltacoronavirus (Adams and Carstens, 2012, Perlman and Netland, 2009).“ / «subclade»:《Evidence for phylogenetic co-segregation of coronaviruses and bat hosts》„Evidence for phylogenetic co-segregation of coronaviruses and bat hosts“ / «clade»: 《Abstract》 „... preliminary evidence for phylogenetic co-segregation of CoVs and bat hosts encompassing the Betacoronavirus clades b and d, with ...“ /
SARS-CoV PHIL 6400 -- wo kommt Stammbezeichnung her?

In SARS-CoV: SARS-CoV PHIL 6400 in der Infobox, innerhalb der Bildlegende.

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Eigentliche Arbeit (https://journals.plos.org/plosmedicine/article?id=10.1371/journal.pmed.0030043) und Abbildung:

Figure 2. Scanning Electron Micrograph Showing the “Rosettelike” Appearance of the Matured SARS-CoV (Coronavirus) Particles (Arrows)

This scanning electron micrograph emphasizes the form and structure of the virus particle, or virion, made visible with negative staining (inset) under transmission electron microscopy. Short and stubby spikes are visible on the virus surface.

(Photo: CDC/Mary Ng Mah Lee, National University of Singapore, Singapore)

https://doi.org/10.1371/journal.pmed.0030043.g002

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Diskussionsbeitrag (https://commons.wikimedia.org/wiki/User_talk:Encephalon~commonswiki#File_source_is_not_properly_indicated:_File:SARS_CoV.jpg)

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Wcam (talk) 21:46, 24 January 2020 (UTC)

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Nochmal Thaler et al. (am 18. Juni 2020)

In Thaler et al. (am 18. Juni 2020 erstmals veröffentlicht) geht es um praktische Aspekte in Augenheilkunde und nicht in erster Linie um Bezeichnung von Viren, mit der sich andere Sachgebiete beschäftigen müssen (z. B. Virologie und Taxonomie) oder könnten (etwa Etymologie, Germanistik, Anglistik). Daher wurden in Thaler et al. sehr kompakte Formulierungen verwendet, die mehrere Sachen gleichzeitig berücksichtigen sollten:

  • die verschiedenen Abkürzungen für ein und desselben Virus, wobei dazu ein einzelner Ausdruck verwendet wurde,
  • die ausgeschriebenen Varianten der Abkürzungsteile in Englisch und in Deutsch (die Zusammenfassung gibt es in beiden Sprachen) und
  • die Beziehung zwischen der ausgeschriebenen Variante (oder der Übersetzung) zur englischen Abkürzung.
  • ... aufgrund der Erfahrungen mit dem „schweres akutes respiratorisches Syndrom-Coronavirus(-1)“ (SARS-CoV(-1)) und ...

Die

Klammern

Pang et al. 2020 Feb 26; PMID 32110875 „and severe acute respiratory syndrome (SARS)-CoV, to guide“

Haider et al. 2020 Feb 26; PMID 32100667 „Novel Coronavirus (2019-nCoV [SARS-COV-2]) was detected“

Morse et al. Epub 2020 Feb 25; PMID 32022370 „its better-studied cousin, SARS-CoV. The spike protein“

Hellewell et al. Epub 2020 Feb 28; PMID 32119825 „controlling a severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-like pathogen. We“

Wang et al. 2020 Feb 24; PMID 32133152 „due to a novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) happened in Wuhan, Hubei“

Yang et al. (2020 Feb); PMID 32175421 „caused by a novel coronavirus [severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)-2], named COVID-19, hit“

Stoecklin et al. (2020 Feb); PMID 32070465 „A novel coronavirus (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2) causing“

Shang et al. Epub 2020 Mar 30; PMID 32225175 „A novel severe acute respiratory syndrome (SARS)-like coronavirus (SARS-CoV-2) recently emerged ...The differences among SARS-CoV-2, SARS-CoV and RaTG13 in ACE2 reco …“

„with a new coronavirus, SARS-CoV-2(1). This outbreak“ -- Fußnote durch hochstellen! : „with a new coronavirus, SARS-CoV-21. This outbreak“

Kaul (ein Autor) Epub 2020 Apr 9; PMID 32363221 „diagnosed novel betacoronavirus or severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV)-2 has spread across“

Zhang et al. (2020 Mar); „diagnosed with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection in“

2020/02/01:2020/11/30[Date - Publication] AND "sars-cov-1"[Title] AND "severe acute respiratory syndrome"[Title/Abstract]

Boardman et al. 2020 Nov 3.; PMID 33142031 „protein antigens to Severe acute respiratory syndrome virus (SARS-CoV-1) and Middle eastern respiratory syndrome virus (MERS-CoV) in Grey-headed flying foxes (Pteropus poliocephalus) …“ – Start groß, nachfolgend klein: „Severe acute …“ und „Middle eastern …“, statt „severe acute …“ und „Middle Eastern …“.

Giannis et al. Epub 2020 Apr 9; PMID 32305883 schrieben einen Review, in welchem sie das jeweilige Virus und die resultierende Krankheit nicht besonders deutlich voneinander abgrenzten. Im Titel: „Coagulation disorders in coronavirus infected patients: COVID-19, SARS-CoV-1, MERS-CoV and lessons from the past“ wird bei drei Viren mit drei Erkrankungen in einer Aufzählung einmal die Krankheit und zweimal das Virus verwendet. In der Text-Stelle: „Coronavirus disease 2019 (COVID-19) or severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a novel coronavirus strain disease, has ...“ wird SARS-CoV-2 nicht als „neuartiger Coronavirus-Stamm“, sondern als „neuartige Krankheit [eines Coronavirus-Stammes]“ bezeichnet.

Nature/ Science/ Cell

2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication] AND "Nature"[Journal] AND "sars-cov-2"[All Fields] - 295 /1.12.20

„Tregoning (2020; PMID 33247293, doi:10.1038/d41586-020-03369-z)“ vom 27. Nov. 2020 ist kein „Artikel“ im klassischen Sinn, sondern eine Art Blog in der CAREER COLUMN in „Nature“; als PubMed-Treffer: „Nature. 2020 Nov 27. doi: 10.1038/d41586-020-03369-z. Online ahead of print.“

https://www.nature.com/articles/d41586-020-03369-z | nature  > career column  > article | CAREER COLUMN / 27 NOVEMBER 2020 / Coronavirus diaries: Reasons to be cheerful, 1, 2, 3 / A second lockdown saps scientific creativity, says John Tregoning, but vaccine news and US election result offer hope at the end of a challenging year. / John Tregoning

2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication] AND "Nature"[Journal] AND "sars-cov-1"[All Fields] - 0 /1.12.20

Wiederh. Nature:

((2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication]) AND ("Nature"[Journal])) AND (sars-cov-2[Title/Abstract]) - 299 /3.12.'20

((2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication]) AND ("Nature"[Journal])) AND (sars-cov-1[Title/Abstract]) - 0 /3.12.'20

((2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication]) AND ("Science (New York, N.Y.)"[Journal])) AND (sars-cov-2[Title/Abstract]) - 76 /1.12.20

((2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication]) AND ("Science (New York, N.Y.)"[Journal])) AND (sars-cov-1[Title/Abstract]) - 1 /1.12.20

Gordon et al. (2020; PMID 33060197) - „Science. 2020 Oct 15;eabe9403. doi: 10.1126/science.abe9403. Online ahead of print.“ - „Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms“ - „The COVID-19 (Coronavirus disease-2019) pandemic, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is ...“ - "SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and MERS-CoV." - Gute Verwendung der Ausdrücke COVID-19, SARS-CoV-2, SARS-CoV-1 und MERS-CoV. Die Abkürzung COVID-19, die der eigentliche Name ist, wird durch ausgeschriebene Form ergänzt, die in Klammern steht und lediglich eine Erklärung des Namens ist.

2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication] AND "Cell"[Journal] AND "sars-cov-2"[Title/Abstract] - 72 /1.12.20

2019/12/01:2020/12/01[Date - Publication] AND "Cell"[Journal] AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] - 2 /1.12.20

Wei et al. 2020; PMID 33147444; „Cell. 2020 Oct 20:S0092-8674(20)31392-1. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.028. Online ahead of print.“ - „Genome-wide CRISPR Screens Reveal Host Factors Critical for SARS-CoV-2 Infection“

  • „for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection may“ / „understanding of coronavirus disease 2019 (COVID-19) pathogenesis.“ / „with SARS-CoV-2, Middle East respiratory syndrome CoV (MERS-CoV), bat CoV HKU5 expressing“ / „complex, that are SARS lineage and pan-coronavirus specific, respectively.“ / „reveals SARS lineage-specific and pan-CoV host factors that regulate susceptibility to highly pathogenic CoVs.“

Wrapp et al. 2020; PMID 32375025; „Cell. 2020 May 28;181(5):1004-1015.e15. doi: 10.1016/j.cell.2020.04.031. Epub 2020 May 5.“ - „Structural Basis for Potent Neutralization of Betacoronaviruses by Single-Domain Camelid Antibodies“

  • Fehlerkorrektur 2020 Jun 11 in PMID 32531248 zu „Cell, volume 181 on page 1004.“: „We recently discovered that ... were switched ... Although this error had no effect on ..., and our conclusions remain unchanged, several ..., and the corresponding text have been amended in the ... versions to correct this.“ Auf der Seite zu Fehlerkorrektur sehen die korregierten Abbildungen (corrected) genau so aus, wie die ursprünglichen (original).
Weitere Recherchen zu Überprüfung

("2020/02/01"[Date - Publication] : "2020/06/30"[Date - Publication]) AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] AND "severe acute respiratory syndrome"[Title/Abstract] - 44/ 3.12.'20

  • Chou et al. (Epub 2020 Jun 24; PMID 32579379): Ann Intern Med. 2020 Oct 6;173(7):542-555. doi: 10.7326/M20-3213. Epub 2020 Jun 24.PMID: 32579379 Free PMC article. Review.
    • Masks for Prevention of Respiratory Virus Infections, Including SARS-CoV-2, in Health Care and Community Settings : A Living Rapid Review.
    • Community mask use was possibly associated with decreased risk for SARS-CoV-1 infection in observational studies. In high- or moderate-risk health care settings, observational studies found that risk for infection with SARS-CoV-1 and Midd …
    • Ausgeschiebene Form von SARS-CoV-2, aber nicht von SARS-CoV-1
      • „... including severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), and ...“ und später „decreased risk for SARS-CoV-1 infection in observational studies.“
      • weiter unten:
      • „Because evidence is limited on SARS-CoV-2, this review also includes evidence on SARS-CoV-1 (causing SARS-1) and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) (causing MERS) and other viral respiratory illness (including influenza and influenza-like illness).“
  • Radhakrishnan et al. (Epub 2020 Jun 22; PMID 32719738): Indian J Otolaryngol Head Neck Surg. 2020 Sep;72(3):398-401. doi: 10.1007/s12070-020-01893-y. Epub 2020 Jun 22.PMID: 32719738 Free PMC article.
    • Guidelines for Surgical Tracheostomy and Tracheostomy Tube Change During the COVID-19 Pandemic: A Review Article.
    • We also did explore the current literature and recommendations for tracheostomy in patients with COVID-19 and studied the previous data from severe acute respiratory syndrome coronavirus 1 (SARS-CoV-1), the virus responsible …
    • Ausgeschiebene Form von SARS-CoV-1 mit Nummer
  • Lin & Yao (2020 Jun 11; PMID 32606823): Infect Drug Resist. 2020 Jun 11;13:1735-1741. doi: 10.2147/IDR.S256773. eCollection 2020.PMID: 32606823 Free PMC article.
    • Potential Role of Nrf2 Activators with Dual Antiviral and Anti-Inflammatory Properties in the Management of Viral Pneumonia.
    • In this article, we reviewed the literature on drug candidates for severe acute respiratory syndrome (SARS-CoV-1) and provided a brief overview of a class of drugs that exert antiviral and anti-inflammatory effects. ...The potentia …
    • Ausgeschiebene Form von SARS-CoV-1 ohne Nummer
  • Rahman et al. (2020 Jun 5; PMID 32528783): 2020 Jun 5;12(6):e8460. doi: 10.7759/cureus.8460.PMID: 32528783 Free PMC article. Review.
    • Neurological and Psychological Effects of Coronavirus (COVID-19): An Overview of the Current Era Pandemic.
    • Data collected from the studies have proposed that COVID-19 is not unusual in demonstrating the neurological symptoms, as it proved in the past by its sister coronaviruses such as severe acute respiratory syndrome coronavirus-1 (SARS-C …
    • Ausgeschiebene Form von SARS-CoV-1 mit Nummer
      • „such as severe acute respiratory syndrome coronavirus-1 (SARS-COV-1) and Middle Eastern respiratory syndrome coronavirus (MERS-COV).“
  • Laine et al. (Epub 2020 May 5; PMID 32369539): Ann Intern Med. 2020 Jul 21;173(2):153-154. doi: 10.7326/M20-2627. Epub 2020 May 5.PMID: 32369539 Free PMC article.
    • Keeping Up With Emerging Evidence in (Almost) Real Time.
    • In Annals' first rapid, living systematic review, Chou and colleagues examined the burden of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), SARS-CoV-1, and Middle East respiratory syndrome …
    • Mal Langform mal Kurzform: SARS-CoV-2 beides, SARS-CoV-1 nur Kurzform und MERS-CoV nur Langform
      • „examined the burden of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), SARS-CoV-1, and Middle East respiratory syndrome coronavirus on health care workers and risk factors for infection.“

("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/03"[Date - Publication]) AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] AND "severe acute respiratory syndrome"[Title/Abstract] - 0 Treffer

fehlerhafte Suche, Wiederholung:

("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/03"[Date - Publication]) AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] AND "severe acute respiratory syndrome"[Title/Abstract] - 110 Treffer /3.12.'20

Ausgeschrieben ohne Ziffer, Abkürzung mit Ziffer

Pozzer et al. (2020 Dec 1; PMID 33236040): Cardiovasc Res. 2020 Dec 1;116(14):2247-2253. doi: 10.1093/cvr/cvaa288.PMID: 33236040

Regional and global contributions of air pollution to risk of death from COVID-19.

Air pollution also causes excess mortality from these conditions. Analysis of the first severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV-1) outcomes in 2003, and preliminary investigations of those for SARS-CoV …

Klammerausdruck!

Segondy (Epub 2020 Oct 31; PMID 33163102): Rev Francoph Lab. 2020 Nov;2020(526):32-39. doi: 10.1016/S1773-035X(20)30311-7. Epub 2020 Oct 31.PMID: 33163102 Free PMC article. French.

[Human coronaviruses].

In addition to these endemic human coronaviruses, three new coronaviruses of zoonotic origin have emerged in the human population over the past 20 years. SARS-CoV (-1) appeared in 2003, MERS-CoV appeared in 2012, and SARS-CoV-2 appeared i …

SARS-CoV als Gruppe!

Gil-Moles et al. (Epub 2020 Oct 19; PMID 32915473): Chemistry. 2020 Nov 26;26(66):15140-15144. doi: 10.1002/chem.202004112. Epub 2020 Oct 19.PMID: 32915473

Gold Metallodrugs to Target Coronavirus Proteins: Inhibitory Effects on the Spike-ACE2 Interaction and on PLpro Protease Activity by Auranofin and Gold Organometallics*.

Herein, we evaluated the lead compound Auranofin and five selected gold organometallics as inhibitors of two relevant drug targets of severe acute respiratory syndrome coronaviruses (SARS-CoV). The gold metallodrugs were effective inhibit …

Umgehung der direkten Erklärung mit den laufenden Nummern

Hoffman et al. (Epub 2020 Oct 15; PMID 33054210): J Med Chem. 2020 Nov 12;63(21):12725-12747. doi: 10.1021/acs.jmedchem.0c01063. Epub 2020 Oct 15.PMID: 33054210 Free PMC article.

Discovery of Ketone-Based Covalent Inhibitors of Coronavirus 3CL Proteases for the Potential Therapeutic Treatment of COVID-19.

The novel coronavirus disease COVID-19 that emerged in 2019 is caused by the virus SARS CoV-2 and named for its close genetic similarity to SARS CoV-1 that caused severe acute respiratory syndrome (SARS) in 200 …

  • „The novel coronavirus disease COVID-19 that emerged in 2019 is caused by the virus SARS CoV-2 and named for its close genetic similarity to SARS CoV-1 that caused severe acute respiratory syndrome (SARS) in 2002. Both SARS coronavirus genomes encode ...“
Ausdruck "SARS-CoVs"

--> zwei Varianten in einem Ausdruck: „CoVs“ Melanthota et al. (Epub 2020 Aug 7; PMID 32770582) – Zitat des RKI (Größe des Virus) https://www.rki.de/DE/Content/InfAZ/N/Neuartiges_Coronavirus/Virologische_Basisdaten.html/ siehe auf der Diskussionsseite zu SARS-CoV-2 (Diskussion:SARS-CoV-2#"Größe" Virus); / PMID 32770582 – Kaniyala Melanthota, S., Banik, S., Chakraborty, I., Pallen, S., Gopal, D., Chakrabarti, S., and Mazumder, N. (2020). Elucidating the microscopic and computational techniques to study the structure and pathology of SARS-CoVs. Microsc Res Tech.

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("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/31"[Date - Publication]) AND "sars-cov-"[Title/Abstract] - 19112 /4.12.'20

("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/31"[Date - Publication]) AND "sars-cov."[Title/Abstract] - 19112 /4.12.'20

("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/31"[Date - Publication]) AND "sars-cov "[Title/Abstract] - 19112 /4.12.'20

("2020/07/01"[Date - Publication] : "2020/12/31"[Date - Publication]) AND "sars-covs"[Title/Abstract] - 20 /4.12.'20

+ Zheng et al. (2020 Dec; PMID 32602823)

  • Bat SARS-Like WIV1 coronavirus uses the ACE2 of multiple animal species as receptor and evades IFITM3 restriction via TMPRSS2 activation of membrane fusion.
  • Zheng M, Zhao X, Zheng S, Chen D, Du P, Li X, Jiang D, Guo JT, Zeng H, Lin H.Emerg Microbes Infect. 2020 Dec;9(1):1567-1579. doi: 10.1080/22221751.2020.1787797.PMID 32602823 Free PMC article.
  • Diverse SARS-like coronaviruses (SL-CoVs) have been identified from bats and other animal species. ...Interestingly, we also found that amphotericin B could enhance the infectious entry of SARS-CoVs and SL-CoVs by evading IFITM3-mediated restric …

+ Kumar et al. (Epub 2020 Nov 6; PMID 33166565)

  • Deletion in the C-terminal region of the envelope glycoprotein in some of the Indian SARS-CoV-2 genome.
  • Kumar BK, Rohit A, Prithvisagar KS, Rai P, Karunasagar I, Karunasagar I.Virus Res. 2021 Jan 2;291:198222. doi: 10.1016/j.virusres.2020.198222. Epub 2020 Nov 6.PMID 33166565 Free PMC article.
  • The envelope glycoprotein (E) is the smallest structural component of SARS-CoVs; plays an essential role in the viral replication starting from envelope formation to assembly. ...However, further studies are indispensable to understand the functional consequences of …

+ Li et al. (2020 Oct 16; PMID 33063820)

  • ACE2 as therapeutic agent.
  • Li Q, Grant MB, Richards EM, Raizada MK.Clin Sci (Lond). 2020 Oct 16;134(19):2581-2595. doi: 10.1042/CS20200570.PMID 33063820
  • ACE2 also has other functions, such as acting as a co-factor for amino acid transport and being exploited by the severe acute respiratory syndrome coronaviruses (SARS-CoVs) as cellular entry receptor, the implications of these functions in development of ACE2-based …

+ Dawood (2020 Oct 3; PMID 33041736)

  • [Glycosylation, Ligand Binding Sites and Antigenic Variations Between Membrane Glycoprotein of COVID-19 and Related Coronaviruses].
  • Dawood AA.Vacunas. 2020 Oct 3. doi: 10.1016/j.vacun.2020.09.005. Online ahead of print.PMID 33041736 Free PMC article. Spanish.
  • RESULTS: We detected high similarity in sequence alignment for > 89% between COVID-19 MP and other MP of CoVs. Prediction of N-glycosylation and cytotoxic T-cell epitopes, we identified precisely sites between SARS-CoV-2 MP and Pangolin CoV MP 100%. ...CONCLUSION …

+ Signer et al. (2020 Sep 9; PMID 32907596)

  • In vitro virucidal activity of Echinaforce, an Echinacea purpurea preparation, against coronaviruses, including common cold coronavirus 229E and SARS-CoV-2.
  • Signer J, Jonsdottir HR, Albrich WC, Strasser M, Züst R, Ryter S, Ackermann-Gäumann R, Lenz N, Siegrist D, Suter A, Schoop R, Engler OB.Virol J. 2020 Sep 9;17(1):136. doi: 10.1186/s12985-020-01401-2.PMID 32907596 Free PMC article.
  • Therefore we investigated the virucidal and antiviral potential of Echinacea purpurea (Echinaforce) against human coronavirus (HCoV) 229E, highly pathogenic MERS- and SARS-CoVs, as well as the newly identified SARS-CoV-2, in vitro. ...The observed virucidal a …

+ Nain et al. (2020 Aug 11; PMID 32778874)

  • Pathogenetic profiling of COVID-19 and SARS-like viruses.
  • Nain Z, Rana HK, Liò P, Islam SMS, Summers MA, Moni MA.Brief Bioinform. 2020 Aug 11:bbaa173. doi: 10.1093/bib/bbaa173. Online ahead of print.PMID 32778874 Free PMC article.
  • Based on phylogram analysis, the 2019-nCoV was found genetically closest to SARS-CoVs. In addition, we identified 562 upregulated and 738 downregulated genes (adj. P 0.05) with SARS-CoV infection. Among the dysregulated genes, SARS-CoV shared 19 upregu …

+ Kaniyala et al. (Epub 2020 Aug 7; PMID 32770582)

  • Elucidating the microscopic and computational techniques to study the structure and pathology of SARS-CoVs.
  • Kaniyala Melanthota S, Banik S, Chakraborty I, Pallen S, Gopal D, Chakrabarti S, Mazumder N.Microsc Res Tech. 2020 Dec;83(12):1623-1638. doi: 10.1002/jemt.23551. Epub 2020 Aug 7.PMID 32770582 Free PMC article. Review.
  • Severe Acute Respiratory Syndrome Coronaviruses (SARS-CoVs), causative of major outbreaks in the past two decades, has claimed many lives all over the world. ...

+ Gahlawat et al. (2020 Aug 4; PMID 32687345)

  • Structure-Based Virtual Screening to Discover Potential Lead Molecules for the SARS-CoV-2 Main Protease.
  • Gahlawat A, Kumar N, Kumar R, Sandhu H, Singh IP, Singh S, Sjöstedt A, Garg P.J Chem Inf Model. 2020 Aug 4:acs.jcim.0c00546. doi: 10.1021/acs.jcim.0c00546. Online ahead of print.PMID 32687345 Free PMC article.
  • The COVID-19 disease is caused by a new strain of the coronavirus family (SARS-CoV-2), and it has affected at present millions of people all over the world. ...It was observed that active site remained conserved among M(pro) of both SARS-CoVs, except at the e …

+ Trigueiro-Louro et al. (2020 Jul 31; PMID 32913581)

  • Unlocking COVID therapeutic targets: A structure-based rationale against SARS-CoV-2, SARS-CoV and MERS-CoV Spike.
  • Trigueiro-Louro J, Correia V, Figueiredo-Nunes I, Gíria M, Rebelo-de-Andrade H.Comput Struct Biotechnol J. 2020 Jul 31;18:2117-2131. doi: 10.1016/j.csbj.2020.07.017. eCollection 2020.PMID 32913581 Free PMC article.
  • There are no approved target therapeutics against SARS-CoV-2 or other beta-CoVs. The beta-CoV Spike protein is a promising target considering the critical role in viral infection and pathogenesis and its surface exposed features. ...Additionally, we have identified …

+ Thoms et al. (2020 Sep 4; PMID 32680882)

  • Structural basis for translational shutdown and immune evasion by the Nsp1 protein of SARS-CoV-2.
  • Thoms M, Buschauer R, Ameismeier M, Koepke L, Denk T, Hirschenberger M, Kratzat H, Hayn M, Mackens-Kiani T, Cheng J, Straub JH, Stürzel CM, Fröhlich T, Berninghausen O, Becker T, Kirchhoff F, Sparrer KMJ, Beckmann R.Science. 2020 Sep 4;369(6508):1249-1255. doi: 10.1126/science.abc8665. Epub 2020 Jul 17.PMID 32680882 Free PMC article.
  • Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent of the current coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. A major virulence factor of SARS-CoVs is the nonstructural protein 1 (Nsp1), which suppresses host gene expression …

+ Xia et al. (2020 Jul 9; PMID 32695180)

  • Coupled CRC 2D and ALI 3D Cultures Express Receptors of Emerging Viruses and Are More Suitable for the Study of Viral Infections Compared to Conventional Cell Lines.
  • Xia S, Liu J, Yang Y, Wu M, Ye L, Chen S, Zhang T, Zeng Z, Zhang K, Cai K, Long X, Gao W, Fang S, Li H.Stem Cells Int. 2020 Jul 9;2020:2421689. doi: 10.1155/2020/2421689. eCollection 2020.PMID 32695180 Free PMC article.
  • Infections of emerging and reemerging viruses (SARS-CoVs, influenza H1N1, etc.) largely and globally affect human health. ...More importantly, these cells express two types of influenza virus receptors, alpha2-6-Gal- and alpha2-3-Gal-linked sialic acids, and angiote …

+ Kim et al. (Epub 2020 May 2; PMID 32304108)

  • Crystal structure of Nsp15 endoribonuclease NendoU from SARS-CoV-2.
  • Kim Y, Jedrzejczak R, Maltseva NI, Wilamowski M, Endres M, Godzik A, Michalska K, Joachimiak A.Protein Sci. 2020 Jul;29(7):1596-1605. doi: 10.1002/pro.3873. Epub 2020 May 2.PMID 32304108 Free PMC article.
  • Although this virus is similar to human and animal SARS-CoVs and Middle East Respiratory Syndrome coronavirus (MERS-CoVs), the detailed information about SARS-CoV-2 proteins structures and functions is urgently needed to rapidly develop effective vacci …

+ Yashavantha et al. (Epub 2020 Apr 29; PMID 32320066)

  • The emergence of a novel coronavirus (SARS-CoV-2) disease and their neuroinvasive propensity may affect in COVID-19 patients.
  • Yashavantha Rao HC, Jayabaskaran C.J Med Virol. 2020 Jul;92(7):786-790. doi: 10.1002/jmv.25918. Epub 2020 Apr 29.PMID 32320066 Free PMC article. Review.
  • Rapid assessment and warning are crucial for an outbreak analysis in response to serious public health. SARS-CoV-2 shares highly homological sequences with SARS-CoVs causing highly lethal pneumonia with respiratory distress and clinical symptoms similar to th …

+ Cascella et al. (2020 Oct 4; PMID 32150360)

  • Features, Evaluation, and Treatment of Coronavirus.
  • Cascella M, Rajnik M, Cuomo A, Dulebohn SC, Di Napoli R.2020 Oct 4. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan–.PMID 32150360 Free Books & Documents. Review.
  • Subsequently, the task of experts of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) termed it the SARS-CoV-2 virus as it is very similar to the one that caused the SARS outbreak (SARS-CoVs). The CoVs have become the major pathogens of …

--

- SARS-CoV-2 attachment to host cells is possibly mediated via RGD-integrin interaction in a calcium-dependent manner and suggests pulmonary EDTA chelation therapy as a novel treatment for COVID 19.

  • Dakal TC.Immunobiology. 2020 Nov 5;226(1):152021. doi: 10.1016/j.imbio.2020.152021. Online ahead of print.PMID 33232865 Free PMC article.
  • As per the literature, the SARS-CoV-2 is known to exploit humanACE2 receptors (similar toprevious SARS-CoV-1) for gaining entry into the host cell for invasion, infection, multiplication and pathogenesis. ...I performed comparative protein sequence analysis, databas …

- Rational development of a human antibody cocktail that deploys multiple functions to confer Pan-SARS-CoVs protection.

  • Yao H, Sun Y, Deng YQ, Wang N, Tan Y, Zhang NN, Li XF, Kong C, Xu YP, Chen Q, Cao TS, Zhao H, Yan X, Cao L, Lv Z, Zhu D, Feng R, Wu N, Zhang W, Hu Y, Chen K, Zhang RR, Lv Q, Sun S, Zhou Y, Yan R, Yang G, Sun X, Liu C, Lu X, Cheng L, Qiu H, Huang XY, Weng T, Shi D, Jiang W, Shao J, Wang L, Zhang J, Jiang T, Lang G, Qin CF, Li L, Wang X.Cell Res. 2020 Dec 1:1-12. doi: 10.1038/s41422-020-00444-y. Online ahead of print.PMID 33262452 Free PMC article.
  • Cryo-EM studies dissected the nature of the P17 epitope, which is SARS-CoV-2 specific and distinctly different from that of H014. High-resolution structure of the SARS-CoV-2 spike in complex with H014 and P17, together with functional investigations revealed that in …

- A review of medications used to control and improve the signs and symptoms of COVID-19 patients.

  • Hushmandi K, Bokaie S, Hashemi M, Moghadam ER, Raei M, Hashemi F, Bagheri M, Habtemariam S, Nabavi SM.Eur J Pharmacol. 2020 Nov 15;887:173568. doi: 10.1016/j.ejphar.2020.173568. Epub 2020 Sep 19.PMID 32956644 Free PMC article. Review.
  • The virus that caused the disease was officially named by the World Health Organization (WHO) as the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). According to the high transmission rate of SARS-CoV-2, it became a global pandemic and public health em …

- Understanding COVID-19 via comparative analysis of dark proteomes of SARS-CoV-2, human SARS and bat SARS-like coronaviruses.

  • Giri R, Bhardwaj T, Shegane M, Gehi BR, Kumar P, Gadhave K, Oldfield CJ, Uversky VN.Cell Mol Life Sci. 2020 Jul 25:1-34. doi: 10.1007/s00018-020-03603-x. Online ahead of print.PMID 32712910 Free PMC article.
  • Multiple sequence alignment data correlated with the already published reports on SARS-CoV-2 evolution indicated that this virus is closely related to the bat severe acute respiratory syndrome-like coronavirus (bat SARS-like CoV) and the well-studied human SARS …

- Evolutionary relationships and sequence-structure determinants in human SARS coronavirus-2 spike proteins for host receptor recognition.

  • Guruprasad L.Proteins. 2020 Nov;88(11):1387-1393. doi: 10.1002/prot.25967. Epub 2020 Jul 4.PMID 32543705 Free PMC article.
  • Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a pandemic infectious disease caused by novel severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS CoV-2). The SARS CoV-2 is transmitted more rapidly and readily than SARS CoV. ...The complete genome analysis of represe …

- S1 Subunit and Host Proteases as Potential Therapeutic Avenues for the Treatment of COVID-19.

  • Arafah A, Ali S, Yatoo AM, Ali MN, Rehman MU.Arch Med Res. 2020 Oct;51(7):718-720. doi: 10.1016/j.arcmed.2020.05.013. Epub 2020 May 21.PMID 32493626 Free PMC article. Review.
  • The novel corona virus (SARS-CoV-2) that causes severe acute respiratory syndrome, now called COVID-19 initially originated in Wuhan city of China and later spread across borders and infected more than five million people and killed over 3.4 lakh people all over the globe. …
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Suche ⟨SARS PC4-227 Tor2⟩ – Publicate Date↑ – 18 Treffer /8.12.'20

Treffer 1: 2020 -- Zheng et al. (2020 Dec; PMID 32602823)

Treffer 2: 2019 -- Kim et al. (2019 Aug; PMID 31076983)

Treffer 3: 2011 -- Soam et al. (2011; PMID 21431562)

Treffer 4: 2007 -- Zhu et al. (2007 Jul; PMID 17620608)

Treffer 5 und 6 (2): 2006 -- { He et al. (2006 Jun; PMID 16731915) -/- He et al. (2006 May 15; PMID 16670317) }

Treffer 7: 2005 -- Neuman (2005 Aug; PMID 16014928)

Treffer 8 bis 12 (5): 2004 -- z. B. Blanchard (2004 Oct; PMID 15489171) /

Zhang et al. (2004 Sep; PMID 15640862) / ...

Treffer 12 bis 18 (7): 2003 -- z. B. Xiao et al. (2003 Dec 26; PMID 14651994) /

Zou et al. (2003 Oct; PMID 14650143), anderes Isolat: SARS-CoV (PUMC01 isolate) / ...

--

Auf den ersten Blick betreffen alle Publikationen (außer vielleicht Zou et al. 2003 Oct; PMID 14650143) das Tor2-Isolat.

Treffer 1: Zheng et al. (2020 Dec; PMID 32602823)

Bat SARS-Like WIV1 coronavirus uses the ACE2 of multiple animal species as receptor and evades IFITM3 restriction via TMPRSS2 activation of membrane fusion.

Zheng M, Zhao X, Zheng S, Chen D, Du P, Li X, Jiang D, Guo JT, Zeng H, Lin H.Emerg Microbes Infect. 2020 Dec;9(1):1567-1579. doi: 10.1080/22221751.2020.1787797.PMID: 32602823 Free PMC article.

Diverse SARS-like coronaviruses (SL-CoVs) have been identified from bats and other animal species. ...We report herein that WIV1 has a broader tropism to ACE2 orthologs than SARS-CoV isolate Tor2. Among the 9 ACE2 orthologs examined, human ACE2 exhibited the …

--

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/labs/virus/vssi/#/virus?SeqType_s=Nucleotide&VirusLineage_ss=Severe%20acute%20respiratory%20syndrome-related%20coronavirus,%20taxid:694009

Recherche im Feb. 2021

10.2.'21

((2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND ("Nature"[Journal])) AND (sars-cov-2[Title/Abstract]) – 28 Treffer | Viele Korrekturen zu früheren Arbeiten, keine Erwähnung des Ausdrucks „SARS-CoV-1“, einmal „SARS-CoV“: Wahl et al. (2021; PMID 33561864 / doi:10.1038/s41586-021-03312-w) – „... all recently emerged human coronaviruses (SARS-CoV, MERS-CoV and SARS-CoV-2) ...“ (Nature. 2021 Feb 9. doi: 10.1038/s41586-021-03312-w. Online ahead of print. „SARS-CoV-2 infection is effectively treated and prevented by EIDD-2801“)

((2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND ("Nature"[Journal])) AND (sars-cov-1[Title/Abstract]) – 0 Treffer

((2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND ("Science (New York, N.Y.)"[Journal])) AND (sars-cov-2[Title/Abstract]) – 28 Treffer | Starr et al. (2021 Jan 25; PMID 33495308, doi:10.1126/science.abf9302): „Here we map how all mutations to SARS-CoV-2's receptor-binding domain (RBD) affect ...“ (Science. 2021 Jan 25;eabf9302. doi: 10.1126/science.abf9302. Online ahead of print. / „Prospective mapping of viral mutations that escape antibodies used to treat COVID-19“) | Gordon et al. (2020; PMID 33060197, PMCID: PMC7808408, doi:10.1126/science.abe9403) „... severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a grave threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV).“ (Comparative Study | Science. 2020 Dec 4;370(6521):eabe9403. doi: 10.1126/science.abe9403. Epub 2020 Oct 15. „Comparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms“)

((2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND ("Science (New York, N.Y.)"[Journal])) AND (sars-cov-1[Title/Abstract]) – 1 Treffer – Gordon et al. (2020 Dec 4) Mechanismen pan-viraler Erkrankungen

(2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND "Cell"[Journal] AND "sars-cov-2"[Title/Abstract] – 21 Treffer | kein „SARS-CoV-1“, kein „SARS-CoV“ gefunden

(2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND "Cell"[Journal] AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] – 1 Treffer | Wei et al. (2021 Jan 7), „Genome-wide CRISPR Screens Reveal Host Factors Critical for SARS-CoV-2 Infection“

13.2.'21

(2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND "sars-cov-1"[Title/Abstract] – 102 Treffer

(2020/12/01:2021/02/28[Date - Publication]) AND "sars-cov-1"[Title] – 5 Treffer

+ Al-Sharif et al. (2021; PMID 32880786, doi:10.1007/s10792-020-01575-2)

  • Ocular tropism of coronavirus (CoVs): a comparison of the interaction between the animal-to-human transmitted coronaviruses (SARS-CoV-1, SARS-CoV-2, MERS-CoV, CoV-229E, NL63, OC43, HKU1) and the eye.
  • Al-Sharif E, Strianese D, AlMadhi NH, D'Aponte A, dell'Omo R, Di Benedetto R, Costagliola C. Int Ophthalmol. 2021 Jan;41(1):349-362. doi: 10.1007/s10792-020-01575-2. Epub 2020 Sep 3. PMID 32880786 Free PMC article. Review.
  • Received 19 May 2020 / Accepted 29 August 2020 / Published 03 September 2020 / Issue Date January 2021. Keine Erklärung der Abkürzungen, SARS-CoV-2 zweimal falsch geschrieben (SARS-Cov-2).

+ Zheng et al. (2021; PMID 33397387, doi:10.1186/s12985-020-01472-1)

  • Neutralization assay with SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spike pseudotyped murine leukemia virions.
  • Zheng Y, Larragoite ET, Williams ESCP, Lama J, Cisneros I, Delgado JC, Slev P, Rychert J, Innis EA, Coiras M, Rondina MT, Spivak AM, Planelles V. Virol J. 2021 Jan 4;18(1):1. doi: 10.1186/s12985-020-01472-1. PMID 33397387 Free PMC article.
  • Received 15 September 2020 / Accepted 16 December 2020 / Published 04 January 2021. Der Ausdruck SARS-CoV-2 wird in der „Introduction“ ausgeschrieben dargestellt, der Ausdruck SARS-CoV-1 wird nicht erklärt. Es gibt ein Abkürzungsverzeichnis, „Abbrevations“, in welchem zwar „SARS“, „SARS-CoV-2“ und „COVID-19“ ausgeschrieben gezeigt werden, in dem aber weder „SARS-CoV“ noch „SARS-CoV-1“ vorkommen. Interessant ist eine Stelle unter „Results“: „... following membrane viral glycoproteins: SARS-CoV spike (hereafter referred to as SARS-CoV-1), SARS-CoV-2 spike, ...“

+ Rodriguez & Gupta et al. (2021; PMID 33441985, doi:10.1038/s41598-020-80942-6)

  • Contact residue contributions to interaction energies between SARS-CoV-1 spike proteins and human ACE2 receptors.
  • Rodriguez JH, Gupta A. Sci Rep. 2021 Jan 13;11(1):1156. doi: 10.1038/s41598-020-80942-6. PMID 33441985 Free PMC article.
  • Scheint nur online zu sein. Received 15 October 2020 / Accepted 30 December 2020 / Published 13 January 2021

+ Sarkar et al. (2021; PMID 33421654, doi:10.1016/j.meegid.2021.104708)

  • Topological Analysis for Sequence Variability: Case Study on more than 2K SARS-CoV-2 sequences of COVID-19 infected 54 countries in comparison with SARS-CoV-1 and MERS-CoV.
  • Sarkar JP, Saha I, Seal A, Maity D, Maulik U. Infect Genet Evol. 2021 Mar;88:104708. doi: 10.1016/j.meegid.2021.104708. Epub 2021 Jan 6. PMID 33421654 Free PMC article.
  • Volume 88, March 2021, 104708 / Beitrag in einer Quartalsausgabe / Check for updates: Document is current

+ Beyer et al. (2021; PMID 33558040, doi:10.1016/j.scitotenv.2021.145413)

  • Shifts in global bat diversity suggest a possible role of climate change in the emergence of SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2.
  • Beyer RM, Manica A, Mora C. Sci Total Environ. 2021 Jan 26:145413. doi: 10.1016/j.scitotenv.2021.145413. Online ahead of print. PMID 33558040 Free PMC article.
  • Available online 26 January 2021, 145413 / In Press, Corrected Proof : Articles in press / Articles in press are accepted, peer reviewed articles that are not yet assigned to volumes/issues, but are citable using DOI.
Acht Versionen später dasselbe -- (Coronaviridae - Versionsgeschichte)

Von neun Versionen (hier v1 bis v9) beschäftigen sich acht (v2 bis v9) letztlich nur mit einer einzigen Version (v1). Vier Versionen sind ungesichtet geblieben (u) und vier Versionen sind lediglich Zurücksetzungen (z) und zwar auf die originale (o), letzte echte Änderung des Artikels „Coronaviridae“.

Taxonomie-Tabelle -- Materialsammlung

Aus "VMR 010820 MSL35.xlsx" (Download "")

Verkürzte Spalten-Beschriftungen:

  • E or A isol. = Exemplar or additional isolate
  • Name(s) = Virus name(s)
  • Name abbr. = Virus name abbreviation(s)
  • Isolate design. = Virus isolate designation
  • GENBANK acc. = Virus GENBANK accession
  • REFSEQ acc. = Virus REFSEQ accession
Species Sort Isolate Sort Genus Subgenus Species E or A isol. Name(s) Name abbr. Isolate design. GENBANK acc. REFSEQ acc.
4982 1 Betacoronavirus Embecovirus Betacoronavirus 1 E human coronavirus OC43 HCoV_OC43 ATCC VR-759 AY585228 NC_006213
4983 1 Betacoronavirus Embecovirus China Rattus coronavirus HKU24 E betacoronavirus HKU24 ChRCoV_HKU24 HKU24-R05005I KM349742 NC_026011
4984 1 Betacoronavirus Embecovirus Human coronavirus HKU1 E human coronavirus HKU1 HCoV_HKU1 HKU1 AY597011 NC_006577
4985 1 Betacoronavirus Embecovirus Murine coronavirus E murine hepatitis virus MHV A59 AY700211 NC_048217
4986 1 Betacoronavirus Embecovirus Myodes coronavirus 2JL14 E Myodes rufocanus vole coronavirus 2/JL2014 MrufCoV_2JL14 KY370046 NC_046954
4987 1 Betacoronavirus Hibecovirus Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 E bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013 Bat_Hp-BetaCoV Zhejiang2013 KF636752 NC_025217
4988 1 Betacoronavirus Merbecovirus Hedgehog coronavirus 1 E hedgehog coronavirus 1 EriCoV 2012-174/GER/2012 KC545383 NC_039207
4989 1 Betacoronavirus Merbecovirus Middle East respiratory syndrome-related coronavirus E Middle East respiratory syndrome-related coronavirus MERS-CoV HCoV-EMC JX869059 NC_019843
4990 1 Betacoronavirus Merbecovirus Pipistrellus bat coronavirus HKU5 E pipistrellus bat coronavirus HKU5 Pi-BatCoV_HKU5 LMH03f EF065509 NC_009020
4991 1 Betacoronavirus Merbecovirus Tylonycteris bat coronavirus HKU4 E tylonycteris bat coronavirus HKU4 Ty-BatCoV-HKU4 B04f EF065505 NC_009019
4992 1 Betacoronavirus Nobecovirus Eidolon bat coronavirus C704 E Eidolon helvum bat coronavirus CMR704-P12 Ei-BatCoV_C704 MG693168 NC_048212
4993 1 Betacoronavirus Nobecovirus Rousettus bat coronavirus GCCDC1 E rousettus bat coronavirus Ro-BatCoV_GCCDC1 GCCDC1 356 KU762338 NC_030886
4994 1 Betacoronavirus Nobecovirus Rousettus bat coronavirus HKU9 E rousettus bat coronavirus HKU9 Ro-BatCoV_HKU9 BF_005I EF065513 NC_009021
4995 1 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus E severe acute respiratory syndrome coronavirus SARS-CoV Tor2 AY274119 NC_004718
4995 2 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A severe acute respiratory syndrome-related coronavirus SARSr-CoV BtKY72 KY352407
4995 3 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 MN908947 NC_045512
4995 4 Betacoronavirus Sarbecovirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus A SARS coronavirus SARS-CoV PC4-227 AY613950

Anmerkungen

  1. ↑ a b Zur klareren und sinnvolleren Unterscheidung zwischen den Coronaviren SARS-CoV und SARS-CoV-2 wird SARS-CoV gelegentlich auch als SARS-CoV-1 bezeichnet (siehe Artikel SARS-CoV).

Refs (Einzelnachweise)

  1. ↑ Alexandre Hassanin: Coronavirus Could Be a ‘Chimera’ of Two Different Viruses, Genome Analysis Suggests, auf: sciencealert vom 24. März 2020 (Quelle: The Conversation)
  2. ↑ Rachel L. Graham, Ralph S. Baric: Recombination, Reservoirs, and the Modular Spike: Mechanisms of Coronavirus Cross-Species Transmission, in: ASM: Journal of Virology 84 (7), März 2010, S. 3134-3146, doi:10.1128/JVI.01394-09, PDF
  3. ↑ Jon Cohen: From mice to monkeys, animals studied for coronavirus answers. In: Science, Band 368, Nr. 6488, 2020, S. 221 f, doi:10.1126/science.368.6488.221, Volltext
  4. ↑ Shi-Hui Sun, You-Chun Wang et al.: A Mouse Model of SARS-CoV-2 Infection and Pathogenesis, in: Cell Host and Microbe vom 26. Mai 2020, doi:10.1016/j.chom.2020.05.020
  5. ↑ Jacinta Bowler: Scientists Find a Way to Infect Mice With Coronavirus. Here's Why That's So Important, auf: sciencealert vom 1. Juni 2020
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  7. ↑ Tina Hesman Saey: Remdesivir may work even better against COVID-19 than we thought, auf: ScienceNews vom 13. Juli 2020
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  9. ↑ Byron E. E. Martina, Bart L. Haagmans, Thijs Kuiken, Ron A. M. Fouchier, Guus F. Rimmelzwaan, Geert van Amerongen, J. S. Malik Peiris, Wilina Lim, Albert D. M. E. Osterhaus: SARS virus infection of cats and ferrets, in: Nature Band 425, S. 915, 30. Oktober 2003, doi:10.1038/425915a, PMID 14586458, PMC  (freier Volltext, PDF)
  10. ↑ Ben Hu, Lei-Ping Zeng, Xing-Lou Yang, Xing-Yi Ge, Wei Zhang, Bei Li, Jia-Zheng Xie, Xu-Rui Shen, Yun-Zhi Zhang, Ning Wang, Dong-Sheng Luo, Xiao-Shuang Zheng, Mei-Niang Wang, Peter Daszak, Lin-Fa Wang, Jie Cui, Zheng-Li Shi; Christian Drosten (Hrsg.): Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus, in: PLOS Pathogens vom 30. November 2017, doi:10.1371/journal.ppat.1006698
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  21. ↑ Prof. Dr. John Ziebuhr: Medizinische Mikrobiologie und Infektiologie. Hrsg.: Sebastian Suerbaum, Gerd-Dieter Burchard, Stefan H. E. Kaufmann, Thomas F. Schulz. 8. Auflage. Springer, Berlin/Heidelberg 2016, ISBN 978-3-662-48677-1, S. 479 ff.
  22. ↑ Prof. Dr. John Ziebuhr: Medizinische Mikrobiologie und Infektiologie. Hrsg.: Sebastian Suerbaum, Gerd-Dieter Burchard, Stefan H. E. Kaufmann, Thomas F. Schulz. 8. Auflage. Springer, Berlin/Heidelberg 2016, ISBN 978-3-662-48677-1, S. 479 ff.
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